如何从 pandas DataFrame 中选择部分字符串?
这篇文章是为想要阅读的读者准备的
- 在字符串列中搜索子字符串(最简单的情况)
- 搜索多个子字符串(类似于
isin)
- 匹配文本中的整个单词(例如,“blue”应该匹配“the sky is blue”而不是“bluejay”)
- 匹配多个完整的单词
- 了解“ValueError: cannot index with vector contains NA / NaN values”背后的原因
...并且想更多地了解哪些方法应该优于其他方法。
(P.S.:我看过很多关于类似主题的问题,我认为最好把它留在这里。)
友情提示,此帖很长。
基本子串搜索
# setup
df1 = pd.DataFrame({'col': ['foo', 'foobar', 'bar', 'baz']})
df1
col
0 foo
1 foobar
2 bar
3 baz
str.contains 可用于执行子字符串搜索或基于正则表达式的搜索。搜索默认为基于正则表达式,除非您明确禁用它。
这是一个基于正则表达式的搜索示例,
# find rows in `df1` which contain "foo" followed by something
df1[df1['col'].str.contains(r'foo(?!$)')]
col
1 foobar
有时不需要正则表达式搜索,因此请指定 regex=False 以禁用它。
#select all rows containing "foo"
df1[df1['col'].str.contains('foo', regex=False)]
# same as df1[df1['col'].str.contains('foo')] but faster.
col
0 foo
1 foobar
性能方面,正则表达式搜索比子字符串搜索慢:
df2 = pd.concat([df1] * 1000, ignore_index=True)
%timeit df2[df2['col'].str.contains('foo')]
%timeit df2[df2['col'].str.contains('foo', regex=False)]
6.31 ms ± 126 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)
2.8 ms ± 241 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)
如果不需要,请避免使用基于正则表达式的搜索。
寻址ValueErrors
有时,对结果执行子字符串搜索和过滤会导致
ValueError: cannot index with vector containing NA / NaN values
这通常是因为您的对象列中存在混合数据或 NaN,
s = pd.Series(['foo', 'foobar', np.nan, 'bar', 'baz', 123])
s.str.contains('foo|bar')
0 True
1 True
2 NaN
3 True
4 False
5 NaN
dtype: object
s[s.str.contains('foo|bar')]
# ---------------------------------------------------------------------------
# ValueError Traceback (most recent call last)
任何不是字符串的东西都不能应用字符串方法,所以结果是 NaN(自然)。这种情况下,指定na=False忽略非字符串数据,
s.str.contains('foo|bar', na=False)
0 True
1 True
2 False
3 True
4 False
5 False
dtype: bool
如何一次将其应用于多个列?
答案就在问题中。使用DataFrame.apply:
# `axis=1` tells `apply` to apply the lambda function column-wise.
df.apply(lambda col: col.str.contains('foo|bar', na=False), axis=1)
A B
0 True True
1 True False
2 False True
3 True False
4 False False
5 False False
下面的所有解决方案都可以使用按列的apply 方法“应用”到多个列(只要您没有太多列,这在我的书中是可以的)。
如果您有一个包含混合列的 DataFrame,并且只想选择对象/字符串列,请查看select_dtypes。
多子串搜索
这很容易通过使用正则表达式 OR 管道的正则表达式搜索来实现。
# Slightly modified example.
df4 = pd.DataFrame({'col': ['foo abc', 'foobar xyz', 'bar32', 'baz 45']})
df4
col
0 foo abc
1 foobar xyz
2 bar32
3 baz 45
df4[df4['col'].str.contains(r'foo|baz')]
col
0 foo abc
1 foobar xyz
3 baz 45
您还可以创建一个术语列表,然后加入它们:
terms = ['foo', 'baz']
df4[df4['col'].str.contains('|'.join(terms))]
col
0 foo abc
1 foobar xyz
3 baz 45
有时,明智的做法是避开您的术语,以防它们包含可解释为regex metacharacters 的字符。如果您的条款包含以下任何字符...
. ^ $ * + ? { } [ ] \ | ( )
然后,您需要使用re.escape 来转义它们:
import re
df4[df4['col'].str.contains('|'.join(map(re.escape, terms)))]
col
0 foo abc
1 foobar xyz
3 baz 45
re.escape 具有转义特殊字符的效果,因此它们被逐字处理。
re.escape(r'.foo^')
# '\\.foo\\^'
匹配整个单词
默认情况下,子字符串搜索搜索指定的子字符串/模式,无论它是否是全字。为了只匹配完整的单词,我们需要在这里使用正则表达式——特别是,我们的模式需要指定单词边界 (\b)。
例如,
df3 = pd.DataFrame({'col': ['the sky is blue', 'bluejay by the window']})
df3
col
0 the sky is blue
1 bluejay by the window
现在考虑,
df3[df3['col'].str.contains('blue')]
col
0 the sky is blue
1 bluejay by the window
v/s
df3[df3['col'].str.contains(r'\bblue\b')]
col
0 the sky is blue
多个全词搜索
与上述类似,只是我们在连接模式中添加了一个单词边界 (\b)。
p = r'\b(?:{})\b'.format('|'.join(map(re.escape, terms)))
df4[df4['col'].str.contains(p)]
col
0 foo abc
3 baz 45
p 看起来像这样,
p
# '\\b(?:foo|baz)\\b'
因为你可以! And you should! 它们通常比字符串方法快一点,因为字符串方法很难向量化并且通常有循环实现。
而不是,
df1[df1['col'].str.contains('foo', regex=False)]
在列表组合中使用in 运算符,
df1[['foo' in x for x in df1['col']]]
col
0 foo abc
1 foobar
而不是,
regex_pattern = r'foo(?!$)'
df1[df1['col'].str.contains(regex_pattern)]
在列表组合中使用re.compile(缓存您的正则表达式)+Pattern.search,
p = re.compile(regex_pattern, flags=re.IGNORECASE)
df1[[bool(p.search(x)) for x in df1['col']]]
col
1 foobar
如果 "col" 有 NaN,那么不是
df1[df1['col'].str.contains(regex_pattern, na=False)]
使用,
def try_search(p, x):
try:
return bool(p.search(x))
except TypeError:
return False
p = re.compile(regex_pattern)
df1[[try_search(p, x) for x in df1['col']]]
col
1 foobar
除了str.contains 和列表推导外,您还可以使用以下替代方法。
np.char.find
仅支持子字符串搜索(阅读:无正则表达式)。
df4[np.char.find(df4['col'].values.astype(str), 'foo') > -1]
col
0 foo abc
1 foobar xyz
np.vectorize
这是一个循环的包装器,但开销比大多数 pandas str 方法要少。
f = np.vectorize(lambda haystack, needle: needle in haystack)
f(df1['col'], 'foo')
# array([ True, True, False, False])
df1[f(df1['col'], 'foo')]
col
0 foo abc
1 foobar
可能的正则表达式解决方案:
regex_pattern = r'foo(?!$)'
p = re.compile(regex_pattern)
f = np.vectorize(lambda x: pd.notna(x) and bool(p.search(x)))
df1[f(df1['col'])]
col
1 foobar
DataFrame.query
通过 python 引擎支持字符串方法。这并没有带来明显的性能优势,但对于了解您是否需要动态生成查询仍然很有用。
df1.query('col.str.contains("foo")', engine='python')
col
0 foo
1 foobar
有关query 和eval 系列方法的更多信息,请访问Dynamic Expression Evaluation in pandas using pd.eval()。
推荐使用优先级
- (First)
str.contains,因为它简单且易于处理 NaN 和混合数据
- 列表推导,因为它的性能(特别是如果您的数据是纯字符串)
np.vectorize
- (最后)
df.query