在 Python 3 中比较 DNA 序列答案

【问题标题】：Comparing DNA sequences in Python 3在 Python 3 中比较 DNA 序列
【发布时间】：2015-03-30 08:28:41
【问题描述】：

到目前为止我的程序是：

seq_a = "TGGAGGCAATGGCGGCCAGCA"
seq_b = "GACTCCTCCTCCTCCTGCTCA"    
len_a = len(seq_a)    
len_b = len(seq_b)    
print("Length of Sequence A: " + str(len_a))    
print()    
print("Length of Sequence B: " + str(len_b))
print()

def sequence_compare(seq_a, seq_b):
        len1 = len(seq_a)
        len2 = len(seq_b)
        mismatches = []
        for pos in range (0, min(len1, len2)) :
              if seq_a[pos] != seq_b[pos]:
                  mismatches.append('|')
              else:
                  mismatches.append(' ')
        print (seq_a)
        print (mismatches)
        print (seq_b)
sequence_compare(seq_a,seq_b)

我希望输出如下：

TGGAGGCAATGGCGGCCAGCA
||||||||| |||||||||
GACTCCTCCTCCTCCTGCTCA

但是输出却是：

TGGAGGCAATGGCGGCCAGCA
['|', '|', '|', '|', '|', '|', '|', '|', '|', ' ', '|', '|', '|', '|', '|', '|', '|', '|', '|', ' ', ' ']
GACTCCTCCTCCTCCTGCTCA

【问题讨论】：

标签： python string list python-3.x

【解决方案1】：

你已经很近了..

print ("".join(mismatches))

会做的伎俩并根据需要打印

||||||||| |||||||||

【讨论】：

感谢工作出色的人！不知道为什么，仍在学习 Python 3
它所做的只是说，“按顺序获取不匹配字符列表，并将它们连接成一个字符串，没有任何分隔。”如果你完成了",".join(mismatches)，你会得到相同的输出，用逗号分隔而不是挤在一起。