循环通过多个目录的 bash 脚本的输出答案

【问题标题】：Output from a bash script looping through multiple directories循环通过多个目录的 bash 脚本的输出
【发布时间】：2012-06-11 17:31:42
【问题描述】：

我目前正在尝试编写一个循环遍历多个目录的脚本。主 raw_data 目录包含约 150 个子目录（subj001、subj002、...、subj00n），每个子目录都有几个子目录。

如何确保将下面给出的脚本的输出发送回输入的特定子目录（例如 subj0012），而不是当前目录 (raw_data)？

#!/bin/bash

for dir in ~raw_data/*
do
  tractor -d -r -b preproc RunStages:1 
done

谢谢。

【问题讨论】：

tractor 是否从当前目录读取其输入，并将输出写入同一目录？从您的示例中可以看出，dir 的当前值不会影响tractor 的工作方式。
是的。这一直是个问题。到目前为止，我一直在手动指定目录来处理这个问题。但是，我尝试过的所有使用循环的脚本都失败了。如果您有任何建议，我将不胜感激。如果我没有足够清楚地提出问题，我深表歉意，但我不是 linux 的高级用户。

【解决方案1】：

您要将输出保存到的目录名称在$dir 中，对吗？因此，只需通过重定向将输出发送到那里：

#!/bin/bash
for dir in ~raw_data/* ; do
    tractor -d -r- b preproc RunStages:1 > $dir/output
done

不过，您应该确保您正在处理的确实是一个目录。

【讨论】：

【解决方案2】：

您可以使用find 的输出来运行循环并将输出附加到所需位置，如下所示：

while read d
do
    echo $d >> ~raw_data/subj0012/output
done < <(find ~raw_data -type d)

【讨论】：