从 bash 脚本调用 conda source activate答案

【问题标题】：calling conda source activate from bash script从 bash 脚本调用 conda source activate
【发布时间】：2016-04-04 17:20:24
【问题描述】：

我正在尝试通过 bash 脚本激活我的 conda env。即使脚本运行良好并且我的 PATH 似乎在脚本中发生了更改，但在脚本终止后它会以某种方式重置。我可以从 cmd 行调用source activate test，它工作正常。一个示例以及下面的输出。

脚本：

PycharmProjects/test » cat ./example.sh
echo "before calling source: $PATH"
source activate test
echo "after calling source: $PATH"

输出：

./example.sh
before calling source: /Use rs/me/miniconda3/bin:/usr/local/bin:/usr/local/sbin:/usr/bin:/bin:/usr/sbin:/sbin:/Library/TeX/texbin

discarding /Users/me/miniconda3/bin from PATH
prepending /Users/me/miniconda3/envs/test/bin to PATH

after calling source: /Users/me/miniconda3/envs/test/bin:/usr/local/bin:/usr/local/sbin:/usr/bin:/bin:/usr/sbin:/sbin:/Library/TeX/texbin`

但是如果我在脚本完成后echo $PATH，你可以看到$PATH没有改变（即没有/Users/me/miniconda3/envs/test/bin）：

PycharmProjects/test » echo $PATH /Users/me/miniconda3/bin:/usr/local/bin:/usr/local/sbin:/usr/bin:/bin:/usr/sbin:/sbin:/Library/TeX/texbin

【问题讨论】：

echo $PATH 在哪里这么说的？您是否将example.sh 作为脚本本身运行（即./example.sh）？而不是sourceing 它（即source example.sh）？
以脚本 (./example.sh) 运行 example.sh。我在脚本运行完成后调用了echo $PATH，只是为了显示 $PATH 实际上并没有改变。
将其作为脚本运行，更改会随着 shell 运行脚本而停止。这就是为什么您首先需要 source 激活脚本以使其适用于正在运行的脚本/shell。
How to source virtualenv activate in a Bash script的可能重复
感谢脚本修复它。

标签： macos shell virtualenv conda

【解决方案1】：

请看下面的链接，

digitalocean-how-to-read-and-set-environmental-and-shell-variables-on-a-linux-vps

下面是网站的sn-p，

这是因为环境变量只传递给子过程。没有内置的环境设置方法父外壳的变量。这在大多数情况下都很好，并且可以防止程序不会影响它们所在的操作环境调用。

【讨论】：

【解决方案2】：

我发现以下内容可以在运行 bash shell 的 Mac OSX 上工作：

#!/bin/bash
source /Users/yourname/anaconda/bin/activate your_env
python --version # example way to see that your virtual env loaded as expected

确保使用以下命令使脚本可执行：

chmod +x yourscript.bash

【讨论】：

它在 ubuntu 18、conda 4.9 上对我有用。它比 Anthony Scopatz 方法花费的时间更少。原因不在我的理解范围内。

【解决方案3】：

在最新版本的 conda (4.6+) 上，我注意到以下工作：

eval "$(conda shell.bash hook)"
conda activate <env-name>

【讨论】：

你能解释一下为什么我们需要eval "$(conda shell.bash hook)"吗？
conda shell.bash hook 返回一个 bash 字符串。我想你可以把它写成一个文件，然后获取那个文件，但是评估它更容易/更快。
@AnthonyScopatz 这解释了你在做什么，但不是为什么。 conda activate <env> 没有那个 eval 表达式就可以正常工作，所以仍然不清楚你为什么要这样做。
当conda activate 错误请求conda init 运行时，这里的eval 表达式使它在没有conda init 的情况下工作。
获取：CommandNotFoundError: Your shell has not been properly configured to use 'conda activate'.