根据文件和文件夹名称的正则表达式匹配将文件复制到文件夹中

Question

我有一种情况，我有一系列文件如下：

1234_A_data1_v1.ext
1234_A_data1_v2.ext
1234_A_data2_v1.ext
1234_A_data2_v2.ext
1234_B_data1_v1.ext
1234_B_data1_v2.ext
1234_B_data2_v1.ext
1234_B_data2_v2.ext
1234_AA_data1_v1.ext
1234_AA_data1_v2.ext
1234_AA_data2_v1.ext
1234_AA_data2_v2.ext
1234_BB_data1_v1.ext
1234_BB_data1_v2.ext
1234_BB_data2_v1.ext
1234_BB_data2_v2.ext

正则表达式字符串1234_[A-Z]+ 标识数据集。我想为每个这样的数据集创建文件夹（基于文件名），然后将相应的文件移动到所述文件夹中。例如，1234_A_data1_v1.ext、1234_A_data1_v2.ext、1234_A_data2_v1.ext、1234_A_data2_v2.ext 将放在文件夹 1234_A 下。

我设法创建了如下文件夹：

grep -o -E '^[0-9]+_[A-Z]+' seqnames | xargs echo | xargs mkdir

这给了我：

1234_A
1234_A_data1_v1.ext
1234_A_data1_v2.ext
1234_A_data2_v1.ext
1234_A_data2_v2.ext
1234_B
1234_B_data1_v1.ext
1234_B_data1_v2.ext
1234_B_data2_v1.ext
1234_B_data2_v2.ext
1234_AA
1234_AA_data1_v1.ext
1234_AA_data1_v2.ext
1234_AA_data2_v1.ext
1234_AA_data2_v2.ext
1234_BB
1234_BB_data1_v1.ext
1234_BB_data1_v2.ext
1234_BB_data2_v1.ext
1234_BB_data2_v2.ext

这一切都很好。但是现在，我不知道如何将文件移动到各自的文件夹中，我很迷茫。

任何关于我如何实现这一点的指针将不胜感激。

特别是，有什么方法可以做类似mv *<pattern>*filename *<pattern>*destination 的事情吗？我也有兴趣了解是否有其他简洁（也许是正确的？）方法来完成这项任务。

Answer 1

好吧，如果所有这些文件都遵循您显示的模式并且位于同一目录中，那么这种单行似乎可以工作。

$ for d in $( cut -f1-2 -d_ <(ls 1234_*) | sort -u ); do mkdir $d; mv ${d}_* $d; done

此 bash 命令使用 Looping Constructfor、Pipeline|、Process Substitution<(...) 和 Command Substitution$(...)。

ls 1234_* 创建与该模式匹配的所有文件的列表。 cut -f1-2 -d_ 在_ 上拆分每个匹配的文件名，然后仅输出前两个字段（包括这两个字段之间的分隔符_）。 sort -u 首先对这些 cut 前缀进行排序，然后仅输出唯一项。您要为目录名称使用的正是这些唯一前缀。 for 然后遍历这些唯一前缀创建目录 (mkdir) 和 mv 将前缀匹配文件添加到该新目录。

谨慎使用并根据需要进行调整。如果此目录中还有其他文件或目录，或者在执行命令时出现错误，执行或重新执行命令可能不会执行您想要的操作，因为会创建目录，glob 将不匹配你想要什么，等等。

这是一个例子。

$ ls -alF   # Show the files in the directory
total 8
drwxrwxr-x.  2 user user 4096 Jul 19 02:15 ./
drwxrwxr-x. 34 user user 4096 Jul 19 02:02 ../
-rw-rw-r--.  1 user user    0 Jul 19 02:07 1234_AA_data1_v1.ext
-rw-rw-r--.  1 user user    0 Jul 19 02:07 1234_AA_data1_v2.ext
-rw-rw-r--.  1 user user    0 Jul 19 02:07 1234_AA_data2_v1.ext
-rw-rw-r--.  1 user user    0 Jul 19 02:07 1234_AA_data2_v2.ext
-rw-rw-r--.  1 user user    0 Jul 19 02:07 1234_A_data1_v1.ext
-rw-rw-r--.  1 user user    0 Jul 19 02:07 1234_A_data1_v2.ext
-rw-rw-r--.  1 user user    0 Jul 19 02:07 1234_A_data2_v1.ext
-rw-rw-r--.  1 user user    0 Jul 19 02:07 1234_A_data2_v2.ext
-rw-rw-r--.  1 user user    0 Jul 19 02:07 1234_BB_data1_v1.ext
-rw-rw-r--.  1 user user    0 Jul 19 02:07 1234_BB_data1_v2.ext
-rw-rw-r--.  1 user user    0 Jul 19 02:07 1234_BB_data2_v1.ext
-rw-rw-r--.  1 user user    0 Jul 19 02:07 1234_BB_data2_v2.ext
-rw-rw-r--.  1 user user    0 Jul 19 02:07 1234_B_data1_v1.ext
-rw-rw-r--.  1 user user    0 Jul 19 02:07 1234_B_data1_v2.ext
-rw-rw-r--.  1 user user    0 Jul 19 02:07 1234_B_data2_v1.ext
-rw-rw-r--.  1 user user    0 Jul 19 02:07 1234_B_data2_v2.ext
$ for d in $( cut -f1-2 -d_ <(ls 1234_*) | sort -u ); do mkdir $d; mv ${d}_* $d; done  # the one-liner
$ ls -alF  # show the directory now
total 24
drwxrwxr-x.  6 user user 4096 Jul 19 02:17 ./
drwxrwxr-x. 34 user user 4096 Jul 19 02:02 ../
drwxrwxr-x.  2 user user 4096 Jul 19 02:17 1234_A/
drwxrwxr-x.  2 user user 4096 Jul 19 02:17 1234_AA/
drwxrwxr-x.  2 user user 4096 Jul 19 02:17 1234_B/
drwxrwxr-x.  2 user user 4096 Jul 19 02:17 1234_BB/
$ tree .  # show the whole directory tree structure
.
├── 1234_A
│   ├── 1234_A_data1_v1.ext
│   ├── 1234_A_data1_v2.ext
│   ├── 1234_A_data2_v1.ext
│   └── 1234_A_data2_v2.ext
├── 1234_AA
│   ├── 1234_AA_data1_v1.ext
│   ├── 1234_AA_data1_v2.ext
│   ├── 1234_AA_data2_v1.ext
│   └── 1234_AA_data2_v2.ext
├── 1234_B
│   ├── 1234_B_data1_v1.ext
│   ├── 1234_B_data1_v2.ext
│   ├── 1234_B_data2_v1.ext
│   └── 1234_B_data2_v2.ext
└── 1234_BB
    ├── 1234_BB_data1_v1.ext
    ├── 1234_BB_data1_v2.ext
    ├── 1234_BB_data2_v1.ext
    └── 1234_BB_data2_v2.ext

4 directories, 16 files