按与文本文件中的行匹配的列标题剪切文件[重复]

Question

我有两个文件，一个包含多列的大文本文件，格式如下：

Col1 Col2 A B C D G H I L N Q S ...
1    0    1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 ...
0    2    1 0 0 0 0 0 2 1 2 3 4 ...
...

和一个包含要匹配的列的文本文件

Col1
Col2
Col3 
B
D
F
...

（请注意，此文件中的某些行可能与大 tsv 文件中的列标题不匹配）

我想根据与文件中给定的列标题匹配的列标题剪切大文件（忽略列标题或文本文件中不匹配的列标题，因此输出文件列标题以Col1 Col2 B D ...开头）

有没有一种简单的方法可以做到这一点，而不是遍历第二个文本文件中的每一行并使用paste 构建一个文件？

这是在 Mac OS X 上，所以使用 ksh，虽然可以使用纯 bash。

Answer 1

然后从 homebrew (brew install miller) 安装 miller 然后

mlr --ipprint --oxtab cat large.txt \
| grep -f <(sed 's/^/^/; s/\./\\./g' cols.txt; echo '^$') \
| mlr --ixtab --opprint cat

Col1 Col2 B D ...
1    0    0 0 ...
0    2    0 0 ...

或者，使用普通的 awk

awk '
  NR==FNR {col[$1]; next}
  FNR == 1 {for (i=1; i<=NF; i++) if ($i in col) wanted[i] = 1}
  {
    for (i=1; i<=NF; i++) if (wanted[i]) printf "%s%s", $i, OFS
    print ""
  }
' cols.txt large.txt

Col1 Col2 B D ...
1 0 0 0 ...
0 2 0 0 ...