【问题标题】:Searching through database with python使用python搜索数据库
【发布时间】:2014-04-27 21:49:15
【问题描述】:

我的问题涉及 python 我正在通过数据库搜索,我想查询 mysql : Species Common_name, genus and species of 序列以“MDPSSID”开头。

有什么建议吗?

【问题讨论】:

  • 您好,一般来说,首先实际向我们展示一些努力被认为是一种好习惯 :)

标签: python mysql bioinformatics


【解决方案1】:

试试

import MySQLdb
db = MySQLdb.connect(host="localhost",
                     user="user",
                      passwd="password", 
                      db="database") 
cur = db.cursor() 
cur.execute("SELECT common_name , genus , species  FROM table WHERE sequence LIKE 'MDPSSID%'")

【讨论】:

  • 这可行,但我们还必须加入一些表,因为物种表中没有所有序列。不过,我一直在寻找 LIKE 命令。谢谢
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