首次执行代码时颜色不正确

Question

我有一个代码可以在一页上绘制多个堆叠条形图。我指定了一个调色板，因此每个数据组都与每个图表中的相同颜色相关联。我发现第一个图表中的颜色不正确，但在所有后续图表中都是正确的。如果我在同一个 R 会话中重新运行代码，所有图表都有正确的颜色。但是，如果我退出 R 并运行代码，则第一个图表的颜色再次错误。

我的代码非常复杂，所以我整理了一个简单的例子来说明问题。同样，在开始新的 R 会话后我第一次运行代码时，颜色不正确。如果代码在同一个 R 会话中重新运行，它们是正确的。

# Data vector for bar plot,
#
dvec        <- c(   0,     0,    0,    0,     0,     0,
                    0,     0,    0,    0,     0,     0,
                    0,     0,    0,    0,     0,     0,
                 1.73,     0,    0,    0,     0,     0,
                 4.81,     0,    0, 0.03,  0.03,     0,
                 2.77,     0,    0, 0.42,  1.04,     0,
                 2.84,  0.02,    0, 2.25,  4.21,  0.02,
                 1.32,  0.54, 0.01, 3.44, 10.49,  0.01,
                 0.13,  1.63, 0.02, 4.42, 17.70,  0.03,
                 0.08,  2.49, 0.03, 8.64, 31.07,  0.02,  
                    0,  3.08, 0.05, 9.04, 50.22,  0.01)

# matrix to pass to barplot, 12 columns, 6 rows

smat <- matrix(dvec,nrow=6)                    

# use this color palette and plot the barchart

zoopal <- palette(c("magenta","red","darkred","yellow","cyan","blue"))

barplot(smat,space=0,col=zoopal,axes=FALSE,axisnames=FALSE,
                  xaxs="i",yaxs="i",ann=FALSE)    

在启动 R 后第一次运行代码时，我得到以下信息：

当我再次运行代码时，我得到了正确的颜色：

我不明白为什么会这样。就好像我指定的调色板在第一次运行代码时没有被使用。我应该注意，虽然我在 MacOSX 10.8.5 下使用 R 版本 3.2.1 开发了 R 代码，但是当代码在同事的 Windows 计算机上运行时会发生同样的事情。谁能解释我做错了什么？谢谢。

Answer 1

我可以在当前版本的 R 和 MacOS 上重现。这似乎与对palette 的（不必要的）调用有关。省略该调用可以解决问题。请注意，这实际上是 ?palette 所描述的预期结果，它说：“一个字符向量给出了是有效的调色板。”（添加了重点）

在我看来，这确实是palette 的一种相当无功能的行为。它显然被设计为充当系统副作用而不是返回当前有用的值，并且返回的值大概应该存储为“oldpal”或类似的东西。正如帮助页面上所讨论的，调色板的使用应该改变（后续）数字到颜色的映射，而不是设置，而不是返回颜色列表。

Answer 2

您根本不需要使用palette()。 barplot 不使用它，你可以只指定一个颜色向量。安维，继续解释：

像这样使用palette() 总是会有延迟。存储x <- palette() 会提供当前 调色板，而不是您刚刚指定的新调色板。例如：

oldcols <- c("red","green")
newcols <- c("yellow","blue")
palette(oldcols)
palette()
#[1] "red"   "green"

runone <- palette(newcols)
runone
#[1] "red"   "green"
palette()
#[1] "yellow" "blue"  

runtwo <- palette(oldcols)
runtwo
#[1] "yellow" "blue"  
palette()
#[1] "red"   "green"