在 FactoMiner R 中提取主成分

Question

我正在尝试使用 FactoMiner 中的 PCA 提取协方差矩阵的主成分。但是，由于某种原因，我只在 var-->coord 变量中看到 n-1 个组件

library(FactoMineR)
x = matrix(rnorm(10000),nrow = 100,ncol = 100)
y = PCA(x,ncp = 100,graph = FALSE)
dim(y$var$coord)

这导致输出 100 99。我是这个包的新手，希望获得更多见解

Answer 1

在对 p 个变量和 n 个观测值执行的主成分分析中，最大维数为 min(p;n-1)。你有一个 100x100 的矩阵，所以 min(100;99) = 1。试试这个 100x101 的矩阵，你将能够提取 100 个维度：

x = matrix(rnorm(10100),nrow = 101,ncol = 100)
y = PCA(x,ncp = 100,graph = FALSE)
dim(y$var$coord)
[1] 100 100

也就是说，PCA 的全部目的是将您的数据减少到几个维度，因此尝试全部使用它们会违背其目的。