Bokeh RuntimeError: 模型必须只属于一个文档，Selection(id='1057', ...) 已经在一个文档中

Question

我正在尝试在 Bokeh 中绘制多个图形，但出现以下错误：

RuntimeError: Models must be owned by only a single document, Selection(id='1057', ...) is already in a doc.

我知道这是在尝试在多个文档中使用相同的对象时造成的，但我不明白我在哪里这样做。这是整个（简化的）代码。

我正在使用 Bokeh 1.4.0。

from bokeh.plotting import figure, show
from bokeh.layouts import row, gridplot
from bokeh.models import ColumnDataSource
from bokeh.io import output_file
import pandas as pd

feature_groups  = [['ciao'],['bye']]


df = pd.DataFrame.from_dict({'x':[0,1,2,3,4], 'y':[2,3,4,5,6]})
x_test = [0,1,2,3,4]
y_test = [2,3,4,5,6]
source = ColumnDataSource(df)


for features_columns in feature_groups:
    output_file('features_labels' + features_columns[0] +'.html')
    p = []

    for k,f in enumerate(features_columns):
        p_k = figure(title=f)
        p_k.circle(x=f, y='ki', line_width=2, source=source,fill_alpha=0.5,line_alpha=0.5)
        p_k.circle_cross( x=x_test, y=y_test, color='red',fill_alpha=0.5,line_alpha=0.5)
        p_k.circle_cross( x = x_test, y = y_test, color='green',fill_alpha=0.5,line_alpha=0.5)
        p_k.xaxis.axis_label = f
        p_k.yaxis.axis_label = 'ki'
        p.append(p_k)
    grid = gridplot(p, ncols=2)
    show(grid)

提前谢谢你

Answer 1

使用这个函数 show_bokeh(grid)

def show_bokeh(plot_fig):
    try:
        bpl.reset_output()
        bpl.output_notebook()
        bpl.show(plot_fig)
    except:
        bpl.output_notebook()
        bpl.show(plot_fig) 

而不是 show()

Answer 2

1) 就像错误所说的每个散景模型（在这种情况下为 ColumnDataSource 的实例）只能添加到散景 Document 一次，所以只需将 source = ColumnDataSource(df) 移动到 for 循环。

编辑（感谢bigreddot）：显然您只能在同一散景Document 中的字形和绘图之间共享相同的source，而不能在不同文档之间共享。 output_file、save 和 show 等方法会隐式创建新的散景 Document，因此在原始代码中使用相同的 source 和两个 output_file 语句总是会导致问题

2) 您引用了 ColumnDataSource 中不存在的字段，例如“ki”等。我将它们替换为 x='x' 和 y='y'

请参阅以下更正且有效的代码：

from bokeh.plotting import figure, show
from bokeh.layouts import row, gridplot
from bokeh.models import ColumnDataSource
from bokeh.io import output_file
import pandas as pd

feature_groups  = [['ciao'],['bye']]

df = pd.DataFrame.from_dict({'x':[0,1,2,3,4], 'y':[2,3,4,5,6]})
x_test = [0,1,2,3,4]
y_test = [2,3,4,5,6]

for features_columns in feature_groups:
    output_file('features_labels' + features_columns[0] +'.html')
    p = []
    source = ColumnDataSource(df)

    for k,f in enumerate(features_columns):
        p_k = figure(title=f)
        p_k.circle(x='x', y='y', line_width=2, source=source,fill_alpha=0.5,line_alpha=0.5)
        p_k.circle_cross( x=x_test, y=y_test, color='red',fill_alpha=0.5,line_alpha=0.5)
        p_k.circle_cross( x = x_test, y = y_test, color='green',fill_alpha=0.5,line_alpha=0.5)
        p_k.xaxis.axis_label = f
        p_k.yaxis.axis_label = 'ki'
        p.append(p_k)
    grid = gridplot(p, ncols=2)
    show(grid)