是否可以在删除节点的同时在 networkX 中为图形设置动画？

Question

我有一个由大约 200 个节点组成的图，我在每次迭代中删除其中的节点。 可以在删除节点的情况下可视化图形，但这样做时节点的位置不会改变。理想情况下，我想移除节点，看看剩余的节点是否靠得更近，以及随着越来越多的节点被移除，集群是否会形成。

我为此使用 networkX。我试图在每次迭代时重新计算图形，但图形的创建方式似乎存在一些随机性。因此，每次迭代我都会得到一个非常不同的图表。

有没有办法实现我想要的？

Answer 1

您可以为此使用draw_networkx：

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt

nodes = [i for i in range(10)]
edges = [(i, i+1) for i in range(5)]
G = nx.Graph()
G.add_nodes_from(nodes)
G.add_edges_from(edges)

positions = {}

for node in nodes:
    positions[node] = (node, node)

nx.draw_networkx(G, pos=positions)

我生成一个带有一些边的 10 个节点的图，然后定义一个 dict，其中键是节点（这里是 1 到 10），值是 (x,y) 格式的坐标。在此示例中，我将节点沿一条线排列。
然后，在下一次迭代中，只需删除不需要的节点并传递相同的 dict。它会跳过丢失的节点，只绘制图中仍然存在的节点：

G.remove_nodes_from([5,6])
nx.draw_networkx(G, pos=positions)

您应该会看到节点 5 和 6 丢失。 .draw_networkx 依赖于 matplotlib，因此您可以执行该库允许的许多事情。更多信息here。

希望对你有帮助！