在 ES5 中，我们可以判断窗口对象上是否存在类
仅当构造函数是全局的，这是不好的做法。
在 ES6 according to this article 中，全局声明的类是全局的，但不是全局对象的属性...
正确。 （let 和 const 在全局范围内的声明也是如此。）这是在 §8.1.1.4: Global Environment Records 中定义的：
全局环境记录在逻辑上是单个记录，但它被指定为封装对象环境记录和声明性环境记录的组合。对象环境记录具有关联领域的全局对象作为其基础对象。这个全局对象是全局环境记录的 GetThisBinding 具体方法返回的值。 （例如，window 在浏览器上引用的全局对象——TJ） 全局环境记录的对象环境记录组件包含所有内置全局变量的绑定（第 18 条）和由包含在全局代码中的 FunctionDeclaration、GeneratorDeclaration 或 VariableStatement 引入的所有绑定。全局代码中所有其他 ECMAScript 声明的绑定都包含在全局环境记录的声明性环境记录组件中。
（我的重点） 所以在 ES5 和更早的版本中用于全局对象的东西仍然可以（加上生成器，因为如果不这样做会更加混乱），但是 新 事物（let、const 和 class 声明）不要。它们是全局变量，但不是全局对象的属性。
回到你的问题...
如果我不能使用if (window.MyClass)，有没有办法做同样的事情？
你可以使用
if (typeof MyClass === "function") {
...因为typeof 在无法解析的符号上不会抛出ReferenceError。这还具有检查MyClass 是否在代码范围内的优点，即使它不是全局的。
这里有一个问题：如果该代码在通过 class（或 let 或 const）声明 MyClass 的同一范围内，但它在 上方 MyClass在该范围内，即使typeof 检查也会抛出ReferenceError，因为在class (或let 或const)。
例如，这会抛出：
if (typeof MyClass === "function") { // ReferenceError here
// Yup, it's defined
// ...
}
// ...
class MyClass {
}
从作用域开始到class、let 或const 行之间的空间称为时间死区 (TDZ)，您无法访问该变量完全有约束力。因此，您必须赶上ReferenceError：
let exists = false;
try {
exists = typeof MyClass === "function";
} catch (e) {
}
实际上有没有不使用窗口对象的正确方法？
在 JavaScript 模块获得广泛的浏览器支持之前，有几种方法：
使用某种异步模块定义库来处理模块的加载。一些例子：RequireJS、SystemJS、CommonJS
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有一个全局变量，您将使用它来引用一个对象，并使您的各种应用程序全局属性成为该对象。这是一种典型的方法：
var MyApp = MyApp || {};
if (!MyApp.ThisModule) { // You can leave this `if` out
// if there's no chance of the file
// being loaded more than once
MyApp.ThisModule = function(module) {
module.MyClass = class MyClass {
// ...class definition here...
}
}({});
}
这也为您提供了一个方便的范围（匿名函数），可以在其中放置任何模块级全局变量。