R yaImpute 中的错误：无法使用 AsciiGridImpute 函数（kNN，GBM）答案

【问题标题】：Error in R yaImpute: cannot use AsciiGridImpute function (kNN, GBM)R yaImpute 中的错误：无法使用 AsciiGridImpute 函数（kNN，GBM）
【发布时间】：2019-10-25 01:51:30
【问题描述】：

我正在使用遥感（Landsat 5 30 米分辨率图像），并希望使用 Landsat 波段的反射率和植被指数作为 X 预测因子以及一组基于地面的生物量测量作为 Y 输出来估计森林树木生物量。我在 yaImpute 包 (R) 中构建了 kNN 模型，并使用相同的数据 - 包 gbm (R) 中的集成提升模型。

现在我想画一张它的光栅图。函数AsciiGridImpute()（用于yai 对象）和AsciiGridPredict()（用于其他对象，如GBM）必须有所帮助。但是我得到了一个错误。

首先，我有 yai-object 和模型，impute 有观察值和预测值：

test_yai <- yai(x = x_center_raw_imp, y = center_knn_raw_imp$dead, k = 10, method = "randomForest")

test_impute <- impute(test_yai, ancillaryData = center_knn_raw_imp$dead)

yai 对象建立在 10 个变量之上：

Coastal, Blue, Green, Red, NIR, SWIR1, SWIR2, NDVI, IPVI, GRVI

对于AsciiGridImpute() 函数，我需要x 变量列表、输出文件和模型列表。所以，有了我的卫星图像的光栅对象，我首先制作了 ascii 文件。

names(Oster_GEE_mask) <- c("Coastal", "Blue", "Green", "Red", "NIR", "SWIR1", "SWIR2", "NDVI", "IPVI", "GRVI") # name layers of raster object as variables in yai object, i.e. kNN model
writeRaster(Oster_GEE_mask[[1]], filename = "Coastal.asc", format="ascii")

等等。所以我为所有 10 个变量编写了 ascii 文件。那么

xfiles <- list(Coastal = "Coastal.asc", Blue = "Blue.asc", Green = "Green.asc",
               Red = "Red.asc", NIR = "NIR.asc", SWIR1 = "SWIR1.asc",
               SWIR2 = "SWIR2.asc", NDVI = "NDVI.asc", IPVI = "IPVI.asc",
               GRVI = "GRVI.asc") # list of my variables
outfiles <- list(dead = "dead.asc") # as I predicted "dead" column in my yai object, I named output file in same way

以及创建栅格地图的功能：

AsciiGridImpute(test_yai, xfiles, outfiles)

但这里有一个错误！

    Rows per dot:  12  Rows to do: 1281 
ToDo: ..........................................................................................................
Done: Error in rownames<-(`*tmp*`, value = saveNames) : 
  attempt to set 'rownames' on an object with no dimensions

yai 对象的变量集与我的 x 文件中的名称相同。有什么问题？（使用 gbm 对象我得到了同样的错误，改用 AsciiGridPredict()）

【问题讨论】：

标签： r knn qgis gbm

【解决方案1】：

我必须阅读 Crookston 等人的著作。（2008 年）首先...

AsciiGridImpute(test_yai, xfiles, outfiles, ancillaryData = x_center_raw_imp) # while I tried first to use object 'impute' as ancillaryData instead of reference file with all variables...

但是，我无法在 AsciiGridPredict() 中实现 gbm() 函数。在这里我不会找到解决方案，貌似需要请科学家们...

【讨论】：