【发布时间】:2011-08-01 03:04:29
【问题描述】:
我有几段测试代码,我一直在不同的机器上运行,总是得到相同的结果。我认为各种 do... 软件包背后的理念是它们可以互换用作 foreach 的 %dopar% 的后端。为什么不是这样?
例如,这段代码 sn -p 有效:
library(plyr)
library(doMC)
registerDoMC()
x <- data.frame(V= c("X", "Y", "X", "Y", "Z" ), Z = 1:5)
ddply(x, .(V), function(df) sum(df$Z),.parallel=TRUE)
虽然这些代码 sn-ps 都失败了:
library(plyr)
library(doSMP)
workers <- startWorkers(2)
registerDoSMP(workers)
x <- data.frame(V= c("X", "Y", "X", "Y", "Z" ), Z = 1:5)
ddply(x, .(V), function(df) sum(df$Z),.parallel=TRUE)
stopWorkers(workers)
library(plyr)
library(snow)
library(doSNOW)
cl <- makeCluster(2, type = "SOCK")
registerDoSNOW(cl)
x <- data.frame(V= c("X", "Y", "X", "Y", "Z" ), Z = 1:5)
ddply(x, .(V), function(df) sum(df$Z),.parallel=TRUE)
stopCluster(cl)
library(plyr)
library(doMPI)
cl <- startMPIcluster(count = 2)
registerDoMPI(cl)
x <- data.frame(V= c("X", "Y", "X", "Y", "Z" ), Z = 1:5)
ddply(x, .(V), function(df) sum(df$Z),.parallel=TRUE)
closeCluster(cl)
在所有四种情况下,foreach(i = 1:3,.combine = "c") %dopar% {sqrt(i)} 产生完全相同的结果,所以我知道我已经安装了这些软件包,并且在我测试过的每台机器上都可以正常工作。
doMC 与 doSMP、doSNOW 和 doMPI 有何不同?
【问题讨论】:
标签: r parallel-processing plyr domc