循环遍历一个表并将该表的信息附加到另一个文件

Question

这是我的第一篇文章，我对 bash 编码相当陌生。 我们在我工作的地方进行了一些实验，为了在 gnuplot 中绘制它，我们需要将反应标签附加到结果。

我们有一个如下所示的文件：

G135b   CH2O+HCO=O2+C2H3
R020b   2CO+H=OH+C2O
R021b   2CO+O=O2+C2O

和一个结果文件（我现在无法访问，抱歉），其中显示文件的第一列是相同的，然后是多个值。它们的顺序不同。 现在我想遍历结果文件并获取第一列的值，在显示的文件中搜索它并将反应标签附加到该行。

1. 如何遍历结果文件的所有行并获取临时变量中第一列的值？ 我想像这样使用这个变量：

   grep -r '^$var' shownfile | awk '{print $2}'
   

   （返回如下内容：CH2O+HCO=O2+C2H3）

2. 如何将该行的结果附加到结果文件中？

编辑：我还写了一个脚本来从一个看起来像这样的文件：

G135b : 0.178273 C H 2 O + H C O = O 2 + C 2 H 3

对此：

G135b CH2O+HCO=O2+C2H3

这是：

#!/bin/bash
file=$(pwd)
cd $file
# echo "$file"
cut -f1,3 $file/newfile >>tmpfile
sed -i "s/://g" tmpfile
sed -i "s/ //g" tmpfile
cp tmpfile newfile

1. 如何在文件中执行剪切命令？就像 -i 用于 sed。我的解决方法非常难看，因为它会在当前目录中创建另一个文件。

谢谢你:)

Answer 1

join 命令将在这里工作，它将在每个文件的第一列（默认情况下）对 2 个文件执行内部连接。

$ cat data
G135b   CH2O+HCO=O2+C2H3
R020b   2CO+H=OH+C2O
R021b   2CO+O=O2+C2O

$ cat result_file
G135b   a b c
R020b   a b
R021b   a b x y z

$ join data result_file
G135b CH2O+HCO=O2+C2H3 a b c
R020b 2CO+H=OH+C2O a b
R021b 2CO+O=O2+C2O a b x y z

Answer 2

使用awk，会是这样的：

NR == FNR { data[$1] = $2; next; }
{ print $0 " " data[$1]; }

将其保存在名为reactions.awk 的文件中，然后调用awk -f reactions.awk shownfile resultfile。

Answer 3

awk  '{a[$1]=a[$1]$2} END{for (i in a){print i,a[i]}}' file1 file2