在R中合并两个数据框答案

【问题标题】：merging two dataframes in R在R中合并两个数据框
【发布时间】：2023-03-06 00:11:01
【问题描述】：

我的数据框中有 139104 行的数据，是 96x1449 的倍数。我有一个表型文件，其中包含 96 个样本的表型信息。 snp 名称重复 1449X96 个样本。我必须基于 sid 和 sen 合并两个数据框。这就是我的两个数据框的样子

dat <- data.frame(
    snpname=rep(letters[1:12],12),
    sid=rep(1:12,each=12), 
    genotype=rep(c('aa','ab','bb'), 12)
)
pheno <- data.frame(
    sen=1:12,
    disease=rep(c('N','Y'),6), 
    wellid=1:12
)

我必须将疾病列和其他 3 个列合并或添加到数据文件中。我无法在 R 中使用合并。我搜索了谷歌，我没有找到正确的术语来获得答案。我将不胜感激有关此问题的任何意见。

谢谢，莎拉德

【问题讨论】：

dat <- merge(dat, pheno, by.x = "sid", by.y = "sen", all=TRUE)
对于以后的使用，不要错过snpMatrix（基因型数据的高效存储，快速 GLM）、snpAssoc（用户友好）或GenABEL 包。大多数允许构建特定的结构（或环境，使用GGtools）来操作和合并基因型和表型数据。
@Ista，下次发帖作为答案。这样一来，你就可以得到一点回报。

标签： r merge

【解决方案1】：

您可以直接使用merge() 指定要匹配的列：

merge(dat, pheno, by.x = "sid", by.y = "sen")

【讨论】：