我正在尝试使用通过搜索字符串返回的索引来查找每个字符实例。当我使用 gregexp（模式，文本）时，
lookfor<-"n"
string<-"ATTnGGCnATTn"
gregexpr(pattern=lookfor,text=string)
我得到以下信息：
[[1]]
[1] 4 8 12
attr(,"match.length")
[1] 1 1 1
attr(,"useBytes")
[1] TRUE
如何索引第一行以便能够使用这些位置？提前感谢您的帮助！
【问题讨论】：
n的字母吗？
标签： regex r indexing string-matching
如果要提取所有匹配项，可以使用内置函数regmatches()
m <- gregexpr(regexp,string)
regmatches(string,m)
这将返回一个字符向量列表，因为字符串可以大于长度 1。如果您只传递一个字符串，您可以绕过列表获得匹配向量
regmatches(string,m)[[1]]
【讨论】：
{n} 语法无效，R 为我抛出错误。这正是你跑的？
这是查找索引的分步方法。我怀疑有更有效的方法可以达到相同的结果。参数 fixed = TRUE 告诉 R 寻找文字小写“n”，而不是将其视为正则表达式。
这样做后，末尾的 [[1]] 部分仅保留列表的索引元素
要显示所有索引，请使用length 函数。
string="ATTnGGCnATTn"
index <- gregexpr(pattern = "n", text = string, fixed = TRUE)[[1]]
first.index <- index[1:length(index)]
【讨论】：
我想我自己想出了答案！ 在 Bioconductor 中使用 Biostrings 包：
string<-"ATTnGGCnATTn"
matches<-matchPattern(pattern="n", subject=string)
m<-as.vector(ranges(matches))
现在我可以调用所有相似字符串中“n”的每个位置。感谢那些花时间回答的人。
【讨论】：
stringr
str_locate_all(string, "n") 给出的结果与gregexpr(pattern=lookfor,text=string)[[1]] 相同，> which(strsplit(string, "")[[1]] == "n") 给出的结果与4 8 12 相同
加法（2）：考虑了一会儿，我得出的结论是，您可以在原来的gregexpr调用中简单地使用unlist
> unlist(gregexpr("n", string))
# [1] 4 8 12
来自您的评论
我正在寻找每个字母n的位置
因此，您可以执行以下任何操作：
> which(strsplit(string, "")[[1]] == "n")
# [1] 4 8 12
> cumsum(nchar(strsplit(string, "n")[[1]])+1)
# [1] 4 8 12
> nc <- 1:nchar(string)
> which(substring(string, nc, nc) == "n")
# [1] 4 8 12
关于类似字符串的加法（1）（在另一个答案中评论）：您可以再次使用strsplit，并使用上述方法之一找到这些值
> string2 <- "ATTTGGCCATTG"
> w <- which(strsplit(string, "")[[1]] == "n")
> strsplit(string2, "")[[1]][w]
[1] "T" "C" "G"
【讨论】：