使用 qdel 一次删除我的所有作业，而不是一次删除一个答案

【问题标题】：Use qdel to delete all my jobs at once, not one at a time使用 qdel 一次删除我的所有作业，而不是一次删除一个
【发布时间】：2015-05-05 15:20:24
【问题描述】：

这是一个相当简单的问题，但我一直无法找到答案。

我有大量作业在集群中运行 (>20)，我想将它们全部删除并重新开始。

根据this site 我应该可以这样做：

qdel -u netid

摆脱它们，但在我的情况下返回：

qdel: invalid option -- 'u'
usage: qdel [{ -a | -c | -p | -t | -W delay | -m message}] [<JOBID>[<JOBID>]|'all'|'ALL']...
   -a -c, -m, -p, -t, and -W are mutually exclusive

这显然表明该命令不起作用。

只是为了检查，我做了：

qstat -u <username>

我确实得到了一份我所有工作的清单，但是：

qdel -u <username>

也失败了。

【问题讨论】：

这是 NQS 排队系统吗？
@Sigismondo 抱歉，我不确定这意味着什么。我对集群管理知之甚少（我不知道），我只是使用它。
为什么qdel -u <username> 会失败？

标签： ssh cluster-computing jobs

【解决方案1】：

基于 Gabriel 的回答：

qselect -u <username> | xargs qdel

qselect -u <username> -s <state> | xargs qdel

<state> 将是 R 仅用于运行作业。

qselect 将允许您根据其他条件选择作业，例如请求的资源 (-l)、目标队列 (-q) ...

qdel -u <username>

仅适用于 SGE

【讨论】：

为什么qdel -u <username> 会失败？
第二种解决方案对我不起作用...

【解决方案2】：

对于 UGE：

qstat -u | gawk '{打印 $1}' | xargs qdel

【讨论】：

【解决方案3】：

在old supercluster.org thread 中找到答案：

qselect -u <username> | xargs qdel

完美运行。

【讨论】：

有没有办法跳过已完成的工作？此解决方案确实有效，但会输出 qdel 试图杀死已完成作业的大部分错误..
嗯，我真的不知道，对不起。
谢谢。只是对于 UGE，该选项是大写的：qselect -U
链接重新上线
将 $USER 用于

【解决方案4】：

试试

$ qdel {id1..id2}

例如：

$ qdel {1148613..1148650}

【讨论】：

【解决方案5】：

qstat | cut -d. -f1 | sed "s;   \(.*\) 0;qdel \1;" | bash

sed 的力量。

【讨论】：

【解决方案6】：

有时一个简单的grep/cut 也可以提供帮助： qstat | grep $USER | cut -d. -f1 | xargs qdel

这样我们还可以grep 为工作提供特定关键字并删除它们。

HTH

【讨论】：

我一直使用它，因为它为其他 grep 搜索增加了很多灵活性。
为什么qdel -u <username> 会失败？
您可能需要根据qstat 输出的外观调整分隔符和字段编号。例如，对我来说，它以两个空格字符开头，所以我使用qstat | grep $USER | cut -d' ' -f3 | xargs qdel。

【解决方案7】：

只需使用以下命令：

qdel all

它将取消在集群上运行的所有作业。

【讨论】：

【解决方案8】：

# Delete all jobs owned by the current user.
# 
# Command breakdown:
# ------------------
#
# qselect
# -u selects all jobs that belong to the current user
# -s EHQRTW selects all job states except for Complete
#
# xargs
# --no-run-if-empty Do not run qdel if the result set is empty
#                   to avoid triggering a usage error.
#
# qdel
# -a delete jobs asynchronously
#
# The backslashes are a trick to avoid matching any shell aliases.

\qselect -u $(whoami) -s EHQRTW | \xargs --no-run-if-empty \qdel -a

【讨论】：

【解决方案9】：

另一种可能性是做qdel all。它会删除所有人的所有工作。当您无权访问其他人的工作时，它只会删除您的工作。

这不是最漂亮的解决方案，但肯定是最短的！

【讨论】：

对我不起作用。 The job all of user(s) <user> does not exist.
为我工作。即使系统报告“未经授权”，它也会按照 guhur 的说明执行操作并仅删除您的工作。