熊猫出现故障？无法覆盖值

Question

所以我尝试运行我之前开发的代码，它已经使用 pandas 很好地运行了很多次。

我的数据框有一个自定义索引（以唯一的字符串值作为索引，代表一个唯一的标识符，在本例中为单个蛋白质），文件名作为列。然后，我使用迭代过程将计数分配给数据框中的某些单元格。所以，假设我有一个带有给定 abritrary 键的默认字典 (my_dict)，其值为 [filename, protein, count]。

我有一个排序的文件名列表和一个排序的蛋白质列表，分别称为 all_filenames 和 all_proteins。

 import pandas as pd
 df = pd.DataFrame(index=all_proteins, columns=all_filenames)

 from collections import defaultdict
 my_dict = defaultdict(list)

 ... (Assign values to the dictionary)

 for key in my_dict:
     my_filename = my_dict[key][0]
     my_protein = my_dict[key][1]
     my_count = my_dict[key][2]

     df[my_filename][my_protein] = my_count

但是，每当我打印 df 时，由于某种原因，在这种情况下它会返回完全空白（具有正确的索引和文件名），而通常不会。

所以为了测试，我对数据框做了以下操作：

>>> my_filename in df.columns.tolist()
True
>>> my_protein in df.index.tolist()
True
>>> df[my_filename][my_protein]
nan
>>> my_count
3.0
>>> type(my_count)
<type 'numpy.float64'>
>>> 
>>> df[my_filename][my_protein] = my_count
>>> df[my_filename][my_protein]
nan
>>> 

我尝试过 df[my_filename].ix[my_protein]、df[my_filename].loc[my_protein]，甚至创建了自定义索引。

通常这个脚本可以正常工作。我的文件名通常是这样的： beta_maxi070214_08，所以没有空格或ASCII字符。

我的蛋白质名称都是标准的，所有名称要么在 UniProtKB 数据库中，要么是两种蛋白质之间的联系（即 ACACA-ACACB）。

我不太确定发生了什么。有人有什么建议吗？

编辑： 这是一个例子：

>>> my_filename 
'beta_orbi080714_05'
>>> my_protein 
'ACACA:K1316-ACACA:K1363'
>>> my_count 
3.0 
>>> type(my_count) 
<type 'numpy.float64'>
>>> df[my_filename][my_protein] = my_count
>>> df[my_filename][my_protein]
nan
>>> 

Answer 1

尝试： df.ix[my_filename,my_protein] = value

原因（据我了解）是 df['x']['y'] 返回数据框的副本。因此，您正在更改一个值，但您正在更改一个副本的值，而不是放回其中。

编辑：DSM 注释，.loc 和 .iloc 通常比 .ix 更受欢迎，后者具有难以解释的语义。这里有一部分文档专门用于解释所涉及的视图与复制问题http://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/indexing.html#returning-a-view-versus-a-copy