在networkx中标记边缘

Question

我正在编写一个基本的神经网络，并希望将其绘制成一张图片。为此，我创建了我需要的所有节点和边。

    for l, j in zip(self.layers, range(len(self.layers))):
        for n, i in zip(l.neurons, range(len(l.neurons))):
            fixed_positions[n.identifier] = (j, i)
    for l in self.layers:
        for n in l.neurons:
            for c, w in zip(n.inconnections, n.inconnectionweights):
               g.add_edge(n.identifier, c.identifier)
    fixed_nodes = fixed_positions.keys()
    pos = nx.spring_layout(g, pos=fixed_positions, fixed=fixed_nodes)

蓝色点（想象它们在所有边缘）是我想在边缘添加标签的地方，但我不知道该怎么做。它应该适用于任何合理的净尺寸，即它也应该适用于相应层中的 4、3 和 2 个神经元。

Answer 1

这是一个在networkx中绘制边缘标签的例子，希望对你有所帮助。

import matplotlib.pyplot as plt
import networkx as nx

edges = [['A', 'B'], ['B', 'C'], ['B', 'D']]
G = nx.Graph()
G.add_edges_from(edges)
pos = nx.spring_layout(G)
plt.figure()
nx.draw(
    G, pos, edge_color='black', width=1, linewidths=1,
    node_size=500, node_color='pink', alpha=0.9,
    labels={node: node for node in G.nodes()}
)
nx.draw_networkx_edge_labels(
    G, pos,
    edge_labels={('A', 'B'): 'AB', 
                 ('B', 'C'): 'BC', 
                 ('B', 'D'): 'BD'},
    font_color='red'
)
plt.axis('off')
plt.show()

Answer 2

您可以使用draw_networkx_edge_labels(edge_labels) 在边缘之​​间绘制标签。

• 如果没有给出edge_labels，则使用edge的属性。
• edge_labels 应该是由文本标签的边缘二元组键控的字典。仅绘制字典中键的标签。

要遍历图形的边缘，您可以使用G.edges。

• G.edges 返回(node1, node2) 的列表，其中node1 和node2 是边的两个节点。
• G.edges(data=True) 返回(node1, node2, ddict) 的列表，其中ddict 是边缘属性字典。
• G.edges(data=attr) 返回(node1, node2, ddict[attr]) 的列表

import matplotlib.pyplot as plt
import networkx as nx

G = nx.DiGraph()

G.add_edges_from([(1, 2), (1, 3), (2, 3)])

pos = nx.spring_layout(G)

nx.draw_networkx(G, pos)

edge_labels = dict([((n1, n2), f'{n1}->{n2}')
                    for n1, n2 in G.edges])

nx.draw_networkx_edge_labels(G, pos, edge_labels=edge_labels)

plt.show()

与G.edges(data=True)

import matplotlib.pyplot as plt
import networkx as nx

G = nx.Graph()
G.add_edge(1, 2, weight=3)
G.add_edge(2, 3, weight=5)

pos = nx.spring_layout(G)

nx.draw(G, pos, with_labels=True)

edge_labels = dict([((n1, n2), d['weight'])
                    for n1, n2, d in G.edges(data=True)])

nx.draw_networkx_edge_labels(G, pos, edge_labels=edge_labels, label_pos=0.9,
                             font_color='red', font_size=16, font_weight='bold')

plt.show()

Answer 3

可以使用G的边缘属性

nx.draw(G, with_labels=True, node_color='skyblue', edge_cmap=plt.cm.Blues, pos = pos)
edge_labels = nx.get_edge_attributes(G,'edge') # key is edge, pls check for your case
formatted_edge_labels = {(elem[0],elem[1]):edge_labels[elem] for elem in edge_labels} # use this to modify the tuple keyed dict if it has > 2 elements, else ignore
nx.draw_networkx_edge_labels(G,pos,edge_labels=formatted_edge_labels,font_color='red')
plt.show()