在 NetworkX 中绘制图形答案

【问题标题】：Draw graph in NetworkX在 NetworkX 中绘制图形
【发布时间】：2013-10-13 07:50:01
【问题描述】：

我正在尝试在 NetworkX 中绘制任何图形，但什么也没得到，甚至没有错误：

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
g1=nx.petersen_graph()
nx.draw(g1)

【问题讨论】：

还要确保您使用的是交互式后端。 matplotlib.get_backend() 返回什么？

标签： python matplotlib ipython ipython-notebook networkx

【解决方案1】：

添加到末尾：

plt.show()

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
g1 = nx.petersen_graph()
nx.draw(g1)
plt.show()

从调用了plt.ion() 的交互式shell 运行时，不需要plt.show()。这可能就是为什么它在很多例子中被省略的原因。

如果您从脚本运行这些命令（其中plt.ion() 尚未被调用），则需要plt.show()。 plt.ion() 可以用于交互式会话，但 not recommended for scripts。

【讨论】：

show() 有帮助。谢谢你。我最终在没有 show() 的情况下保存了数字。

【解决方案2】：

在 ipython notebook 中，只需输入 magic

%matplotlib inline

或

%matplotlib notebook

【讨论】：

【解决方案3】：

您可以使用 jupyter notebook 轻松绘制 networkx 图表。见第一个例子。

或者，您可以使用Bokeh 绘制图形，这增加了有用的功能。 holoviews 包使绘制散景图变得更加简单。它在悬停在节点上时添加了自动突出显示和显示标签等功能。但是，编辑颜色等似乎是一个问题。

%pylab inline  
# `pylab notebook`  # for interactive plots

import pandas as pd
import networkx as nx
import holoviews as hv

G=nx.Graph()
ndxs = [1,2,3,4]
G.add_nodes_from(ndxs)
G.add_weighted_edges_from( [(1,2,0), (1,3,1) , (1,4,-1) , (2,4,1) , (2,3,-1), (3,4,10) ] ) 
nx.draw(G, nx.spring_layout(G, random_state=100))

这里是散景和全息视图的例子：

hv.extension('bokeh')
%opts Graph [width=400 height=400]
padding = dict(x=(-1.1, 1.1), y=(-1.1, 1.1))
hv.Graph.from_networkx(G, nx.layout.spring_layout).redim.range(**padding)

你应该试一试，把它画在你的笔记本上看看有什么不同。

【讨论】：

【解决方案4】：

通过添加它可以正常工作：

import matplotlib.pyplot as plt
plt.show()

到您的代码。我的工作正常。

【讨论】：