从 MATLAB 调用 Python 函数

Question

我需要从 MATLAB 调用 Python 函数。我该怎么做？

Answer 1

您可以先embed your Python script in a C program，然后再MEX the C program with MATLAB，但与将结果转储到文件相比，这可能需要大量工作。

您可以使用PyMat 在 Python 中调用 MATLAB 函数。除此之外，SciPy 有几个 MATLAB 重复函数。

但如果您需要从 MATLAB 运行 Python 脚本，您可以尝试运行 system 命令来运行脚本并将结果存储在一个文件中，稍后在 MATLAB 中读取它。

Answer 2

我对我的系统有类似的要求，这是我的解决方案：

在 MATLAB 中有一个名为 perl.m 的函数，它允许您从 MATLAB 调用 perl 脚本。根据您使用的版本，它将位于类似的位置

C:\Program Files\MATLAB\R2008a\toolbox\matlab\general\perl.m

创建一个名为 python.m 的副本，用 python 快速搜索和替换 perl，仔细检查它设置的命令路径以指向你的 python 安装。您现在应该可以从 MATLAB 运行 python 脚本了。

示例

python 中保存为“sqd.py”的简单平方函数，如果我正确执行此操作，我自然会在测试输入参数、有效数字等方面进行一些检查。

import sys

def squared(x):
    y = x * x
    return y

if __name__ == '__main__':
    x = float(sys.argv[1])
    sys.stdout.write(str(squared(x)))

然后在 MATLAB 中

>> r=python('sqd.py','3.5')
r =
12.25
>> r=python('sqd.py','5')
r =
25.0
>>

Answer 3

由于Python 是一种更好的粘合语言，因此从Python 调用程序的MATLAB 部分可能更容易，反之亦然。

查看Mlabwrap。

Answer 4

由于MATLAB 与 Java 无缝集成，您可以使用Jython 编写脚本并从 MATLAB 调用它（您可能需要添加一个纯 JKava 瘦包装器才能真正调用 Jython 代码）。我从未尝试过，但我不明白为什么它不起作用。

Answer 5

我已将 perl.m 调整为 python.m 并将其附上以供其他人参考，但我似乎无法从 Python 脚本中获得任何输出以返回到 MATLAB 变量:(

这是我的 M 文件；请注意，我在代码中直接指向 Python 文件夹 C:\python27_64，这会在您的系统上发生变化。

function [result status] = python(varargin)
cmdString = '';
for i = 1:nargin
    thisArg = varargin{i};
    if isempty(thisArg) || ~ischar(thisArg)
        error('MATLAB:python:InputsMustBeStrings', 'All input arguments must be valid strings.');
    end
    if i==1
        if exist(thisArg, 'file')==2
            if isempty(dir(thisArg))
                thisArg = which(thisArg);
            end
        else
            error('MATLAB:python:FileNotFound', 'Unable to find Python file: %s', thisArg);
        end
    end
  if any(thisArg == ' ')
    thisArg = ['"', thisArg, '"'];
  end
  cmdString = [cmdString, ' ', thisArg];
end
errTxtNoPython = 'Unable to find Python executable.';
if isempty(cmdString)
  error('MATLAB:python:NoPythonCommand', 'No python command specified');
elseif ispc
  pythonCmd = 'C:\python27_64';
  cmdString = ['python' cmdString];  
  pythonCmd = ['set PATH=',pythonCmd, ';%PATH%&' cmdString];
  [status, result] = dos(pythonCmd)
else
  [status ignore] = unix('which python'); %#ok
  if (status == 0)
    cmdString = ['python', cmdString];
    [status, result] = unix(cmdString);
  else
    error('MATLAB:python:NoExecutable', errTxtNoPython);
  end
end
if nargout < 2 && status~=0
  error('MATLAB:python:ExecutionError', ...
        'System error: %sCommand executed: %s', result, cmdString);
end

编辑：

解决了我的问题，原来的 perl.m 通过更新 PATH 然后调用 Perl 指向 MATLAB 文件夹中的 Perl 安装。上面的函数指向我的 Python 安装。当我调用我的function.py 文件时，它位于不同的目录中并调用了该目录中的其他文件。这些没有反映在 PATH 中，我不得不将我的 Python 文件轻松安装到我的 Python 发行版中。

Answer 6

最简单的方法是使用MATLAB 的system 函数。

所以基本上，您可以在 MATLAB 上执行 Python 函数，就像在命令提示符 (Windows) 或 shell (Linux) 上一样：

system('python pythonfile.py')

以上内容仅用于运行 Python 文件。如果你想运行一个 Python 函数（并给它一些参数），那么你需要这样的东西：

system('python pythonfile.py argument')

举个具体的例子，把 Adrian 对这个问题的回答中的 Python 代码保存到一个 Python 文件中，即test.py。然后将此文件放在您的 MATLAB 目录中并在 MATLAB 上运行以下命令：

system('python test.py 2')

您将得到 4 或 2^2 作为输出。

注意：MATLAB 在当前 MATLAB 目录中查找您使用 system 命令指定的任何 Python 文件。

这可能是解决您的问题的最简单方法，因为您只需使用 MATLAB 中的现有函数进行投标。

Answer 7

这似乎是从Python 到MATLAB 的“隧道”函数的合适方法：

http://code.google.com/p/python-matlab-wormholes/

最大的优势是你可以用它来处理 ndarrays，这在程序的标准输出中是不可能的，如前所述。 （请纠正我，如果您认为这是错误的 - 它会为我省去很多麻烦 :-)）

Answer 8

试试这个 MEX 文件，从 MATLAB 中实际调用 Python，而不是像其他人建议的那样反过来。它提供了相当不错的集成：http://algoholic.eu/matpy/

你可以很容易地做这样的事情：

[X,Y]=meshgrid(-10:0.1:10,-10:0.1:10);
Z=sin(X)+cos(Y);
py_export('X','Y','Z')
stmt = sprintf(['import matplotlib\n' ...
'matplotlib.use(''Qt4Agg'')\n' ...
'import matplotlib.pyplot as plt\n' ...
'from mpl_toolkits.mplot3d import axes3d\n' ...
'f=plt.figure()\n' ...
'ax=f.gca(projection=''3d'')\n' ...
'cset=ax.plot_surface(X,Y,Z)\n' ...
'ax.clabel(cset,fontsize=9,inline=1)\n' ...
'plt.show()']);
py('eval', stmt);

Answer 9

正如@dgorissen 所说，Jython 是最简单的解决方案。

只需从homepage 安装 Jython。

然后：

javaaddpath('/path-to-your-jython-installation/jython.jar')

import org.python.util.PythonInterpreter;

python = PythonInterpreter; %# takes a long time to load!
python.exec('import some_module');
python.exec('result = some_module.run_something()');
result = python.get('result');

有关示例，请参阅 the documentation。

注意：我从未真正使用过 Jython，而且似乎人们可能从 CPython 中了解到的标准库并未在 Jython 中完全实现！

我测试的小示例运行良好，但您可能会发现您必须将 Python 代码目录添加到 sys.path。

Answer 10

关于MATLAB 的system() 函数的一个鲜为人知（和documented）的事实：在unixoid 系统上，它使用环境变量SHELL 或MATLAB_SHELL 在启动时给出的任何解释器MATLAB。因此，如果您使用

启动 MATLAB

SHELL='/usr/bin/python' matlab

任何后续的system() 调用都将使用Python 而不是您的默认shell 作为解释器。

Answer 11

使用 Matlab 2014b 可以调用 python 库directly from matlab。前缀py.被添加到所有数据包名称：

>> wrapped = py.textwrap.wrap("example")

wrapped = 

  Python list with no properties.

    ['example']

Answer 12

从 Matlab 2014b 开始可以直接调用 Python 函数。 使用前缀 py，然后是模块名称，最后是函数名称，如下所示：

result = py.module_name.function_name(parameter1);

如果您与 Python 脚本的工作目录不同，请确保在从 Matlab 调用时将脚本添加到 Python 搜索路径。

查看更多详情here。

Answer 13

正如丹尼尔所说，您可以使用 py.xml 直接从 Matlab 运行 python 命令。命令。要运行任何库，您只需确保 Malab 正在运行您安装库的 python 环境：

在 Mac 上：

• 打开一个新的终端窗口；

• type：哪个python（查找python默认版本安装在哪里）；

• 重启 Matlab；

• 在命令行中键入：pyv​​ersion('/anaconda2/bin/python')（显然替换为您的路径）。
• 您现在可以运行默认 python 安装中的所有库。

例如：

py.sys.version;

py.sklearn.cluster.dbscan