Slurm：为什么我们需要在 Sbatch 脚本文件中使用 Srun？答案

【问题标题】：Slurm: Why do we need Srun in Sbatch script file?Slurm：为什么我们需要在 Sbatch 脚本文件中使用 Srun？
【发布时间】：2021-01-27 07:58:31
【问题描述】：

我是 Slurm 的新手，我还发现了有关此主题的相关问题。但是，我仍然对如何使用 srun 的几点感到困惑。根据官方文档，srun 通常会先分配资源，然后运行并行作业。例如，我想运行 20 个任务，如果我根据以下脚本提交作业，我不确定创建了多少个任务。因为 sbatch 只负责分配资源而不是执行程序。

#!/bin/sh
#SBATCH -n 20
#SBATCH --mpi=pmi2
#SBATCH -o myoutputfile.txt
module load mpi/mpich-x86_64
mpirun mpiprogram < inputfile.txt

如果我尝试像下面这样运行顺序程序，我不知道是否会有差异。例如，我可以简单地删除此脚本中的 srun 命令。会发生什么？

#!/bin/sh
#SBATCH -n 1
#SBATCH -N 1
srun tar zxf julia-0.3.11.tar.gz
echo "prefix=/software/julia-0.3.11" > julia/Make.user
cd julia
srun make

【问题讨论】：

标签： slurm

【解决方案1】：

第一个示例将产生 20 个任务； sbatch 将请求 20 个 CPU 并设置环境以便mpirun 知道该作业请求了多少 CPU。然后mpirun 将产生与分配一样多的进程（前提是 OpenMPI 是在 Slurm 支持下编译的）。

#SBATCH --mpi=pmi2 部分用于srun，因此如果在提交脚本中未调用srun，它将无效。

在第二个示例中，生成的进程数量没有区别，因为只需要一个。但是，使用srun，sstat 的输出会更可靠，信号的管理会更精确，输出的缓冲也会更可控（通过srun 命令行选项）。

如果您请求多个任务，srun 将实例化那么多进程。它可以是 MPI 程序，也可以是根据 SLURM_PROC_ID 环境变量调整其行为的顺序程序。

您也可以在同一个提交脚本中运行多个srun。 srun 的每个实例（称为“步骤”）然后在会计 (sacct) 中单独计算。

最后，srun 可以使用分配的子集，并在单个作业中组织许多小任务的微调度（参见 srun 手册页中的示例）。

【讨论】：