【发布时间】:2021-07-07 02:21:17
【问题描述】:
从具有 A B D P 列的数据框开始:
import numba
import numpy as np
import pandas as pd
import vaex
d = {'A':[0,1,2,3,4,5,6],'B':[30,35,32,35,31,39,37],'D':[12,10,13,19,12,21,13],'P':[3,3,3,3,3,3,3]}
df = pd.DataFrame(data=d)
df['C'] = 0
df
导出到 hdf5:
df.to_csv("v_df", index=False)
df = vaex.from_csv("v_df", convert=True, chunk_size=5_000_000)
我需要计算每行的“C”列,所需结果如下:
'C': [0, 1.666666667, 0.552380952, 2.333630952, 0.962202381, 6.38155722, 5.714890553]
要达到这个结果,我需要从第 (1) 行开始迭代每一行并计算如下内容:
%%time
@numba.njit
def func(B, D, C, b_0=0):
n = len(B)
b = np.full(n, b_0, dtype=np.float64)
for i in range(1, n):
b[i] = ((((B[i] - B[i - 1]) / B[i - 1])) * D[i]) + C[i-1]
return b
df['C'] = func(df['B'].to_numpy(),df['D'].to_numpy(),df['C'].to_numpy())
df
但它不起作用。
第一行和第二行结果正常:
'C': [0, 1.666666667, -1.114286, 1.781250, -1.371429, 5.419355, -0.666667]
我已经尝试过“转变”(sammywemmy 的建议)。在“vaex.from_csv”之前的这个示例数据帧可以正常工作,但是当通过 vaex 将概念实现到大数据帧时,移位不起作用。
所以,问题是:是否有一种“良好实践”的方法来执行这种演算(迭代“C”列中的一行的结果,考虑到“C”中的前几行)使用大型数据源(I´ m 使用 vaex 从 100 万行 csv 导入)?
提前致谢。
【问题讨论】:
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试试这个:
df.B.shift(-1).sub(df.B).div(df.B).mul(df.D.shift(-1)).cumsum().shift(fill_value=0) -
sammywemmy,感谢您的快速回答和帮助...它非常适合我的示例 createad 和一个简单的 pandas 数据框!谢谢!但是......当我尝试将这个概念从 vaex 实施到大数据框架时,它不起作用。显示消息:'AttributeError: 'Expression' object has no attribute 'shift''。感谢您的帮助...
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我对vaex不熟悉;你可以看看他们的 API 看看是否有替代
shift -
再次感谢您的帮助和善意。谢谢!
标签: python pandas numpy numba vaex