如何在 bash 脚本中从 matlab 获取返回值？

Question

如果我有这个 matlab 函数

function [result] = matlab_test(param1, param2)

disp(sprintf('param1 : %s', param1));
disp(sprintf('param2 : %s', param2));

result = 'hello matlab';

我想在 bash 脚本中调用这个 matlab 函数，比如

matlab -nodesktop -nosplash -nodisplay -r "try, A=matlab_test('test','matlab'); end; quit"
echo $A

我想要这个输出

test
matlab
hello matlab

我在这里的要求是找出是否可以在我的 bash 脚本中使用来自 Matlab 的返回值，并通过管道传递它。我只想将我的应用程序分成小组件（文件）并通过管道/参数进行通信。简而言之，我想看看我可以在我的 bash 脚本中将 Matlab 脚本包装到多远，以便我可以设置我的代码架构。
如果我不能这样做，我将简单地将我需要从 matlab 返回值的部分捆绑到 matlab 脚本中。

Answer 1

您在这里尝试做两件事。首先：在 shell 中显示 Matlab 程序的输出。其次，在shell中分配一个变量。

当我尝试这个时，我发现 Matlab 会在标准输出上写满它的开头消息，所以我最终这样做了：

mkfifo ~/matlab_output
matlab ... > /dev/null & cat ~/matlab_output

然后在 matlab 中，将 sprintf 替换为：

f = fopen('~/matlab_output', 'w');
fprintf(f, 'param1 : %s', param1);
fclose(f);

这是您第一个要求的一种解决方案（您可以只写入一个普通文件，然后再对文件进行 cat 处理，但您必须为此使用 &&，所以在 Matlab 之前您不会看到输出完全完成了。）。您遇到的第二个问题 - 在 matlab 中执行“A = result”并能够在 shell 中“回显 $A” - 更难。你可以这样做：

mkfifo ~/matlab_commands
mkfifo ~/matlab_output
matlab ... > /dev/null & cat ~/matlab_output & eval $(cat ~/matlab_commands)

在matlab中：

f2 = fopen('~/matlab_commands', 'w');
fprintf(f2, 'A=%s', double2str(results));
fclose(f2);

但我真的不知道这会有多好。

Answer 2

你问了两个问题。我会回答这两个问题，包括为什么第二个可能是不可能的，具体取决于您的操作系统（在我的操作系统上绝对不可能），然后提供有关问题相关解决方法的建议。

首先，我在让 Matlab 与 shell 交互时使用这样的脚本。

#!/bin/sh 

cat <<EOF | matlab -nodesktop -nosplash -nodisplay 
A=matlab_test('$1','$2');
system(['export temp1=' A]); %doesn't work
setenv('temp2',A); %also doesn't work, I'll explain why below
exit
EOF
echo $temp1
echo $temp2

给出输出：

[XXXXXX@compute-0-138 ~]$ ./stack_ex test matlab
Warning: No window system found.  Java option 'MWT' ignored

                            < M A T L A B (R) >
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                               March 18, 2011


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>> param1 : test
param2 : matlab
>> >> >> 

很明显，设置环境变量的两个版本都行不通。这就引出了您的第二个问题。

“回显”失败的原因是 system 和 setenv 创建的 shell 在 Matlab 关闭时会关闭。也就是说，Matlab 不能在调用它的 shell 之外设置环境变量。

in this posting 讨论的 Windows 系统有一个解决方法，它使用 Microsoft 的工具。还提到了here。

我不相信 *nix 系统可以从 Matlab 中设置环境变量。

这是一种与您描述的类似的方法。

我假设使用 echo 不是您真正想要做的。相反，我猜您想使用存储在环境变量中的字符串输出，以便进一步处理 shell 中的命令或脚本。一种可能的解决方法如下：

#!/bin/sh 

cat <<EOF | matlab -nodesktop -nosplash -nodisplay 
A=matlab_test('$1','$2');
setenv('temp1',A); %doesn't work
[a b] = system(['echo ' '$' 'temp1'])
exit
EOF

给出输出： [XXXXXX@compute-0-138 ~]$ ./stack_ex_3 测试 matlab 警告：未找到窗口系统。 Java 选项“MWT”被忽略

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>> param1 : test
param2 : matlab
>> >> 
a =

     0


b =

hello matlab

这表明命令echo $temp1 在setenv 创建的子shell 中进行了评估，并且temp1 保存了分配给它的值。这个对 shell 的调用的结果现在存储在 b 中（a 保持 0 表示成功）。可以想象，您可以通过 system 命令传递您想要在 shell 中执行的全部操作，以便它在子 shell 中运行。不过，我们必须了解您的问题的更多细节才能对这种方法进行全面评估。

编辑和跟进 **********************

我能想到的最接近包装 Matlab 和 bash 的方法是以下技巧。您可以使用以下命令将 Matlab 脚本的输出通过管道传输到 myresult.out：

#!/bin/sh 

cat <<EOF | matlab -nodesktop -nosplash -nodisplay /> myresult.out 
A=matlab_test('$1','$2');
disp(['grepMe ' A])
exit
EOF

您可以从myresult.out grep grepMe 行，通过管道传输到 sed，然后只选择您需要的输出行的一部分，然后在脚本的其余部分通过管道传输。这与我认为您可以实现的目标一样接近。

Answer 3

这几天一直在思考这个问题，只是想到了一些事情。您可以将其中一个 MATLAB 克隆用作 #!脚本解释器。我的选择是 Octave，就像这样：

#! /usr/bin/octave -qf
A=matlab_test('test','matlab');
printf(A)

printf 将 A 的值放入 STDOUT 中，您可以从那里进行管道传输。

matteson@mauler[~]$ ./oshelltest
param1 : test
param2 : matlab
hello matlab
matteson@mauler[~]$ ./oshelltest | grep hello
hello matlab

现在 Octave 与 MATLAB 不完全相同，但它很接近，也许足以满足您的需求。它还具有免费的优势。