热图的图例比例

Question

我有一张下表：

Samples      Mean1  Mean2 Diff
   A          125    250    2
   B          100    200    2
   C          150     75   -2
   D          50     150   -3

现在我想生成一个热图，其中颜色代码块应表示平均值，而图例应表示“Diff”列相对于热图中平均值的最大值和最小值...我尝试了 pheatmap 包R，但图例完全基于平均值，即最大值为 250，最小值为 50，但我想要相对于 Diff 列中的相应值，即最小值为 -3，最大值为 2..

谁能帮帮我

Answer 1

如果我理解正确，您希望单元格（和图例）的颜色代表“DIFF”列值吗？你想在单元格中显示平均值吗？

例如如下截图所示？

您可以使用heatmap.2()（gplots 包）中的cellnote 参数来执行此操作。 单元格注释值独立于您用于“着色”单元格的值。