R编程：想要生成随机频率答案

【问题标题】：R programming: Want to generate random frequenciesR编程：想要生成随机频率
【发布时间】：2014-06-02 07:40:45
【问题描述】：

我想使用 R 生成随机频率（即频率必须等于 1）来模拟群体中的基因频率。我的解决方案是：

freq<- function(x,y)  #random frequency generator, no defined distribution
    {rn<-sample(1:y,x)
    sum <- sum(rn)
    for(i in 1:x){
    RG[i]=rn[i]/sum}
    return(RG)
    }

关于如何在除法之前将总和限制为特定值（例如随机数必须等于 100）的任何建议？

【问题讨论】：

选择 x-1 样本，然后选择 1 - sum(RG)。觉得这段代码看起来效率不高。
您可以将现有函数重写为function(x, y) prop.table(sample(y, x))

标签： r random-sample frequency-distribution genetics

【解决方案1】：

不妨试试这个：

从均匀分布中生成样本
排序值
加0和1
使用值作为值的分界点

这可能不清楚，所以这里是示例！

set.seed(1)
x <- sort(runif(10))
x
## [1] 0.06178627 0.20168193 0.26550866 0.37212390 0.57285336 0.62911404 0.66079779 0.89838968 0.90820779 0.94467527
x <- c(0,x,1)
y <- diff(x)
y
## [1] 0.061786270 0.139895661 0.063826732 0.106615236 0.200729464 0.056260681 0.031683749 0.237591892 0.009818105 0.036467479 0.055324731
sum(y)
## [1] 1

【讨论】：

【解决方案2】：

试试这个：

 freq <- function(x,y)  #random frequency generator, no defined distribution
{ 
  ds <- 50             #desired sum

  # assuming an appropriate range and relation between ds, x and y

  for(i in 1:100) {
    rn0 <- sample(1:y,x-1)  
    if(sum(rn0) < ds) break()
  }

  rn <- c(rn0, ds - sum(rn0))             #desired freq

  sum <- sum(rn)
  RG <- 1:x
  for(i in 1:x){
    RG[i]=rn[i]/sum}
  return(RG)
}

【讨论】：