每次重复后，keras 模型的训练都会变慢

Question

我正在编写一些代码来优化神经网络架构，因此有一个 python 函数create_nn(parms) 可以创建和初始化一个 keras 模型。 但是，我遇到的问题是，在较少的迭代之后，模型的训练时间比平时要长得多（最初一个时期需要 10 秒，然后在大约第 14 个模型之后（每个模型训练 20 个时期）需要 60 秒/时代）。 我知道这不是因为不断发展的架构，因为如果我重新启动脚本并开始它是否结束，它就会恢复正常速度。

我正在跑步

from keras import backend as K

然后是一个

K.clear_session()

在训练任何给定的新模型之后。

一些额外的细节：

• 对于前 12 个模型，每个 epoch 的训练时间大致保持在 10 秒/epoch。然后在第 13 个模型每个 epoch 的训练时间稳步攀升至 60 秒。然后每个 epoch 的训练时间徘徊在 60 秒/epoch 左右。

• 我正在以 Tensorflow 作为后端运行 keras

• 我正在使用 Amazon EC2 t2.xlarge 实例

• 有大量可用 RAM（7GB 可用，数据集大小为 5GB）

我已经删除了一堆层和参数，但基本上create_nn 看起来像：

def create_nn(features, timesteps, number_of_filters):
    inputs = Input(shape = (timesteps, features))
    x = GaussianNoise(stddev=0.005)(inputs)
    #Layer 1.1
    x = Convolution1D(number_of_filters, 3, padding='valid')(x)
    x = Activation('relu')(x)
    x = Flatten()(x)
    x = Dense(10)(x)
    x = BatchNormalization()(x)
    x = Activation('relu')(x)
    x = Dropout(0.5)(x)
    # Output layer
    outputs = Dense(1, activation='sigmoid')(x)
    model = Model(inputs=inputs, outputs=outputs)

    # Compile and Return
    model.compile(optimizer = 'adam', loss = 'binary_crossentropy', metrics = ['accuracy'])
    print('CNN model built succesfully.')
    return model

请注意，虽然 Sequential 模型可以在这个虚拟示例中工作，但实际用例需要功能 API。

我该如何解决这个问题？

Answer 1

为什么每次跑步后我的训练时间都会增加？

简短回答：您需要在创建每个新模型之前使用tf.keras.backend.clear_session()。

这个问题似乎只发生在急切执行关闭时。

好的，让我们在有和没有 clear_session 的情况下运行一个实验。 make_model 的代码在此响应的末尾。

首先，我们来看看使用 clear session 时的训练时间。我们将运行这个实验 10 次并打印结果

使用 tf.keras.backend.clear_session()

non_seq_time = [ make_model(clear_session=True) for _ in range(10)]

使用 clear_session=True

non sequential
Elapse =  1.06039
Elapse =  1.20795
Elapse =  1.04357
Elapse =  1.03374
Elapse =  1.02445
Elapse =  1.00673
Elapse =  1.01712
Elapse =    1.021
Elapse =  1.17026
Elapse =  1.04961

如您所见，训练时间基本保持不变

现在让我们在不使用 clear session 的情况下重新运行实验并查看训练时间

不要使用 tf.keras.backend.clear_session()

non_seq_time = [ make_model(clear_session=False) for _ in range(10)]

使用 clear_session=False

non sequential
Elapse =  1.10954
Elapse =  1.13042
Elapse =  1.12863
Elapse =   1.1772
Elapse =   1.2013
Elapse =  1.31054
Elapse =  1.27734
Elapse =  1.32465
Elapse =  1.32387
Elapse =  1.33252

如您所见，训练时间在没有 clear_session 的情况下会增加

完整代码示例

# Training time increases - and how to fix it

# Setup and imports

# %tensorflow_version 2.x

import tensorflow as tf
import tensorflow.keras.layers as layers
import tensorflow.keras.models as models
from time import time

# if you comment this out, the problem doesn't happen
# it only happens when eager execution is disabled !!
tf.compat.v1.disable_eager_execution()


(x_train, y_train), (x_test, y_test) = tf.keras.datasets.mnist.load_data()


# Let's build that network
def make_model(activation="relu", hidden=2, units=100, clear_session=False):
    # -----------------------------------
    # .     HERE WE CAN TOGGLE CLEAR SESSION
    # -----------------------------------
    if clear_session:
        tf.keras.backend.clear_session()

    start = time()
    inputs = layers.Input(shape=[784])
    x = inputs

    for num in range(hidden) :
        x = layers.Dense(units=units, activation=activation)(x)

    outputs = layers.Dense(units=10, activation="softmax")(x)
    model = tf.keras.Model(inputs=inputs, outputs=outputs)
    model.compile(optimizer='sgd', loss='sparse_categorical_crossentropy', metrics=['accuracy'])

    results = model.fit(x_train, y_train, validation_data=(x_test, y_test), batch_size=200, verbose=0)
    elapse = time()-start
    print(f"Elapse = {elapse:8.6}")
    return elapse

# Let's try it out and time it

# prime it first
make_model()

print("Use clear session")
non_seq_time = [ make_model(clear_session=True) for _ in range(10)]

print("Don't use clear session")
non_seq_time = [ make_model(clear_session=False) for _ in range(10)]