PostgreSQL 错误：列 am.amcanorder 不存在答案

【问题标题】：PostgreSQL Error: column am.amcanorder doesn't existPostgreSQL 错误：列 am.amcanorder 不存在
【发布时间】：2016-11-20 12:31:31
【问题描述】：

我正在开发基于 CentOS 版本 6.8（最终版）的服务器，但没有 sudo 访问权限。我编译了 PostgreSQL v9.6 beta 2。

当我使用 ant 加载数据时，我得到 am.amcanorder column doesn't exist 错误，我不知道如何解决。

我正在按照教程设置 Intermine 数据仓库系统，我在 this step。

 ant -Dsource=uniprot-malaria -v

这需要几分钟才能完成，命令运行以下步骤：

检查 project.xml 中是否存在名为 uniprot-malaria 的源
在 src.data.dir 指定的位置读取 UniProt XML 文件
调用包含在 uniprot 源中的解析器，其列表为文件，这会读取原始 XML 并创建项目将被加载到疟疾胺数据库。
这些项目存储在中间项目数据库中。读取自项目数据库，将项目转换为对象并将它们加载到疟疾胺数据库。

粗体部分是（在我看来）导致错误的原因。相关的详细错误是：

org.postgresql.util.PSQLException: ERROR: column am.amcanorder does not exist
  Position: 407
        at org.postgresql.core.v3.QueryExecutorImpl.receiveErrorResponse(QueryExecutorImpl.java:2161)
        at org.postgresql.core.v3.QueryExecutorImpl.processResults(QueryExecutorImpl.java:1890)
        at org.postgresql.core.v3.QueryExecutorImpl.execute(QueryExecutorImpl.java:255)
        at org.postgresql.jdbc2.AbstractJdbc2Statement.execute(AbstractJdbc2Statement.java:559)
        at org.postgresql.jdbc2.AbstractJdbc2Statement.executeWithFlags(AbstractJdbc2Statement.java:403)
        at org.postgresql.jdbc2.AbstractJdbc2Statement.executeQuery(AbstractJdbc2Statement.java:283)
        at org.postgresql.jdbc2.AbstractJdbc2DatabaseMetaData.getIndexInfo(AbstractJdbc2DatabaseMetaData.java:4234)
        at org.intermine.task.CreateIndexesTask.execute(CreateIndexesTask.java:212)
        at org.apache.tools.ant.UnknownElement.execute(UnknownElement.java:288)

【问题讨论】：

@ErwinBrandstetter 已更新，尽管我认为问题出在 postgresql 本身而不是我正在运行的代码...
这肯定是 Postgres 错误消息。在表 am 中找不到列 amcanorder。不过，我不知道为什么。
是的，我找不到任何真实的信息，至少不是我所理解的。如果我以某种方式克服了这个错误，我会回答我自己的问题。
您能检查一下am 表是否存在吗？如果没有，是否有另一个表包含 amcanorder 列？可能表名已更新，但初始化代码/脚本未更新。
JDBC 驱动程序的更新已作为拉取请求合并到 intermine（这是 OP 正在谈论的软件），因此该问题应在上游修复 github.com/intermine/intermine/pull/1475

标签： postgresql ant

【解决方案1】：

这个问题已经通过编译 v9.5.3 解决了，这是目前最新的稳定版本。以前，我使用的是 v9.6beta2 ... 在使用 JDBC 和 v9.6beta2 时，它有一个 reported error。

【讨论】：

【解决方案2】：

Player87 是对的，它只需将较新版本的 9.6* 替换为 PostgresSQL 服务器 的 9.5.*。
但是，还有另一种解决方案。对于 Java 项目，我还尝试将 PostgresSQL server 保留在 9.6.* 上，并将 PostgresSQL 驱动程序从 9.4-1203 版本更新到最新的 9.4-1211。在 maven pom.xml 文件中：

<postgresql.version>9.4.1211</postgresql.version>

这对我也有用。

【讨论】：

谢谢。工作得很漂亮。我不喜欢我的日志中报告的非关键错误。让我不安。
移动到最新的驱动程序版本解决了 java 的问题。
从 9.4.1208 升级到 9.4.1211 也适用于我。
在 Hive 2.3.8 从 9.4.1208 升级到 9.4.1212 时为我工作

【解决方案3】：

我在使用 SpringBoot 时遇到了同样的问题，并通过升级我的驱动程序解决了这个问题

对于 Spring Boot 1.4.0，我刚刚添加了以下依赖项

<dependency> <groupId>org.postgresql</groupId> <artifactId>postgresql</artifactId> </dependency>

【讨论】：

这是真的，但前提是你的项目是 Spring Boot 的子模块，因为它继承了 Spring Boot 的依赖项。此外，不指定版本会导致使用最新版本。

【解决方案4】：

对我来说（从 Java/Maven 应用程序连接到 PostgreSQL 并面临同样的错误）这是一个驱动程序问题。

将 PostgreSQL 驱动程序从 9.4-1201-jdbc41 更新到 42.1.4 解决了这个问题。我的 Maven 依赖项现在看起来像这样：

    <dependency>
        <groupId>org.postgresql</groupId>
        <artifactId>postgresql</artifactId>
        <version>42.1.4</version>
    </dependency>

【讨论】：

是的。我遇到了同样的问题，42.1.4 以上版本可以正常工作
对于9.6，可以使用42.2.6版本。

【解决方案5】：

就我而言，我使用的是 PostgreSQL 驱动程序 (9.4.1204)，并且与 hive 外部元存储不兼容。用https://jdbc.postgresql.org/download.html的最新版本替换后工作。

【讨论】：