在 R 中创建大矩阵 [重复]

Question

如何在 R 中创建一个大矩阵，或者如何将一个大矩阵压缩到某个对象中？

y <- matrix(rnorm(2e4*2e4),1:20000,1:20000)
Error: cannot allocate vector of size "..." Gb

如何分配这个矩阵？

Answer 1

我是big.memory 软件包的忠实粉丝，我是 Windows 用户。 为了使用这个包，我首先选择使用 R 2.15，因为它在 CRAN 上仍然有一个可用的 Windows 版本的 big.memory 包。对于 R 3.0，我必须编译那个旧版本才能使用我的大矩阵。

Answer 2

我不知道我为什么要给出一个严肃的答案，但这里是......

1.我可以安装bigmemory就好了。也许如果您遇到问题，您应该分享错误消息、您的环境和操作系统，然后寻求帮助。

2.也许这只是一个例子：

  y <- outer(1:20000,1:20000)
  Error: cannot allocate vector of size "..." Gb

但你真的想这样做吗？难道你不能重构你的代码来多次迭代/重新采样一个较小的矩阵，或者一次读取一点数据，也就是说......

3.您考虑过使用 RSQlite 吗？它非常易于安装，尤其是现在使用 dplyr 软件包非常用户友好。