合并csv文件时带引号的字符串警告中的EOF答案

【问题标题】：EOF within quoted string warning when merging csv files合并csv文件时带引号的字符串警告中的EOF
【发布时间】：2021-10-22 11:41:32
【问题描述】：

我有 70 多个 CSV 文件，我正在尝试按行合并它们（它们都有相同的列）。我尝试使用以下代码将它们组合起来：

library(tidyverse)
library(plyr)
library(readr)
setwd("*\\data")
myfolder="test"
allfiles= list.files(path=myfolder, pattern="*.csv", full.names = T)
allfiles
combined_csv= ldply(allfiles, read.csv)

运行此代码后，我会收到一条警告消息：

Warning message:
In scan(file = file, what = what, sep = sep, quote = quote, dec = dec,  :
  EOF within quoted string

看起来我丢失了一些行。我该如何解决这个问题？

【问题讨论】：

标签： r csv import merge read.csv

【解决方案1】：

当其中一些具有一些“字符”元素而一些只是数字时，不同文件中的相同列可能会被读取为不同的类型。这是一种读取所有列指定为“字符”列的方法，rbind 元素，然后使用type.convert 根据其具有的值自动转换列类

library(data.table)
out <- rbindlist(lapply(list.files(path=myfolder, full.names = TRUE), 
       fread, colClasses = "character"))
out <- type.convert(out, as.is = TRUE)

【讨论】：

【解决方案2】：

试试这个：

library(dplyr)
library(readr)

myfolder="test" 

df <- list.files(path=myfolder, full.names = TRUE) %>% 
  lapply(read_csv) %>% 
  bind_rows

【讨论】：

看起来这个方法对列的类很敏感。我收到此错误消息：'错误：无法组合 List Desig Agt 1 - CREA ID 和 List Desig Agt 1 - CREA ID "' 看起来相同的列名在两个 Excel 表中具有不同的类，这就是我收到此错误的原因
我不确定，但试试这个：df <- list.files(path=myfolder, full.names = TRUE) %>% type.convert(as.is = TRUE) lapply(read_csv) %>% bind_rows
不幸的是给出了同样的错误。当我扩展错误时，它显示：Can't combine List Desig Agt 1 - CREA ID` 和 List Desig Agt 1 - CREA ID .`
我希望我可以在这里分享数据以获得更多说明，但这真的很难，因为它们有很多 excel 文件
试试：df <- list.files(path=myfolder, full.names = TRUE) %>% lapply(read_csv) %>% bind_rows %>% readr::type_convert()