为什么抑制 Rmarkdown 中的错误不起作用？

Question

我想抑制 Rmw 文件中的错误。所以，我尝试设置全局块选项error=TRUE，但它不起作用。此外，直接在块中设置块选项error=TRUE 也不起作用。 这是一个示例代码：

\begin{document}
\SweaveOpts{concordance=TRUE}

abc 
<<setup, cache=F, include=F>>=
library(knitr)
library(formatR)
opts_chunk$set(error=TRUE)
knit_hooks$set(error=TRUE)
@

<<a,error=TRUE>>=
A <- 5
# of course, that doesnt work, but i want the error message as chunk output
A * B
@
\end{document}

我不明白为什么它不起作用

只有错误信息： “评估错误（expr，.GlobalEnv）：找不到对象'L'” 出现。

Answer 1

您似乎使用的是来自基本 R 的 Sweave 而不是 knitr。如果您使用的是knitr，则会收到有关\SweaveOpts{concordance=TRUE} 语句的警告。

如果您使用的是 RStudio，这是项目选项之一。如果你直接运行，运行knitr::knit("<your filename>")，而不是Sweave("<your filename>")。

还有一些其他错误会阻止knitr 工作；这个版本修复了它们：

\documentclass{article}

\begin{document}

abc 
<<setup, cache=F, include=F>>=
library(knitr)
library(formatR)
opts_chunk$set(error=TRUE)
@

<<a,error=TRUE>>=
A <- 5
# of course, that doesnt work, but i want the error message as chunk output
A * B
@
\end{document}

变化是：

• 您需要在开头使用 \documentclass 行。
• 您不想要\SweaveOpts{concordance=TRUE} 语句。
• 您不想要knit_hooks$set(error=TRUE) 语句。