根据从 matlab 或 R 中的第二个文件中选择的标题从文件中提取列答案

【问题标题】：extract columns from file based on header selected from 2nd file in matlab or R根据从 matlab 或 R 中的第二个文件中选择的标题从文件中提取列
【发布时间】：2018-09-15 22:10:32
【问题描述】：

我有一个大文本表，制表符分隔。第一行是标题。然后我有第二个文本文件，其中包含第一个文件中标题的子集。我想提取第一个文件的所有列，其标题包含在第二个文件中给出的列表中。这是输入和所需输出的示例：

数据.txt

 head0 head1 head2 head3 head4  
 1 25 1364 22 13  
 2 10 215 1 22

列表.txt

head0  
head4

期望的输出

head0 head4  
1 13  
2 22

【问题讨论】：

使用read.table读取两个数据集，然后使用df1[df2[[1]]如果第二个数据集列是factor，则将其转换为characterdf1[as.character(df2[[1]])]

标签： r matlab indexing subset

【解决方案1】：

我们可以为此使用base R 方法

df1[df2[[1]]]

数据

#specify the `sep` as well
df1 <- read.table('Data.txt', header = TRUE, stringsAsFactors = FALSE)
df2 <- read.table('List.txt', header = FALSE, stringsAsFactors = FALSE)

【讨论】：

【解决方案2】：

我认为R 这样做很简单（假设您可以轻松读取数据）。会是这样的

mydata <- read.table('data_filename.txt', header=T, ...)

# This one looks like header=F in your example...not quite sure how your data is structured
mycolumns <- read.table('columns_filename.txt', header=F, ...)

# x should be the name of the column
final_data <- dplyr::select(mydata, mycolumns$x)

代码不完整，但应该很容易计算出细节它也可以通过子集在基础 R 中完成（参见其他答案）。

【讨论】：