【发布时间】：2021-11-24 18:10:20
【问题描述】：
试图在终端上安装rpy2 模块，但没有任何动作。
尝试在单元格上直接安装rpy2
!pip install rpy2
%load_ext rpy2.ipython
%%R -i data
data <- list('0.47', '-0.36', '-0.5', '0.2', '0.35', '1.82',
'-0.78', '-0.91', '0.36', '-1.74', '0.24', '0.76',
'0.57', '2.32', '1.55', '-1.31', '-0.09', '-0.02',
'-0.07', '-0.19', '-0.25',
'-1.09', '0.64', '1.22', '-0.56', '1.76', '0.13',
'1.33', '-0.74', '-1.15', '1.63', '1.04', '-0.26',
'0.02', '-1.2', '0.37', '0.43', '0.04', '1.34',
'0.57', '0.76', '-1.25', '-0.05', '0.12', '0.8',
'-0.99', '-0.11', '-0.54', '-0.08', '-0.04', '-0.76',
'-0.8', '0.35', '1.54', '-0.99', '-0.35', '-0.28', '0.45',
'-0.04', '-0.06', '0.02', '0.58', '-0.32', '-0.1', '0.28',
'0.3', '-0.36', '0.81', '0.79', '0.21', '1.81', '0.19', '0.84',
'0.2', '-0.06', '-0.11', '-1.4', '-2.08', '0.88', '-0.14',
'-0.96', '1.3', '0.06', '-0.37', '1.49', '-0.91',
'1.14', '-1.05', '1.49', '-0.79', '2.02', '0.38', '2.4', '1.25',
'0.5', '1.11', '-0.54', '-0.1', '0.63', '1.01')
num <- as.numeric(unlist(data))
shapiro.test(num)
shapiro.test
结果显示
File "<ipython-input-3-0be657748cce>", line 20
num <- as.numeric(unlist(data))
^
SyntaxError: invalid syntax
还是不行
我只想将 R 代码附加到我的 Jupyter 笔记本上。
data <- list('0.47', '-0.36', '-0.5', '0.2', '0.35', '1.82',
'-0.78', '-0.91', '0.36', '-1.74', '0.24', '0.76',
'0.57', '2.32', '1.55', '-1.31', '-0.09', '-0.02',
'-0.07', '-0.19', '-0.25',
'-1.09', '0.64', '1.22', '-0.56', '1.76', '0.13',
'1.33', '-0.74', '-1.15', '1.63', '1.04', '-0.26',
'0.02', '-1.2', '0.37', '0.43', '0.04', '1.34',
'0.57', '0.76', '-1.25', '-0.05', '0.12', '0.8',
'-0.99', '-0.11', '-0.54', '-0.08', '-0.04', '-0.76',
'-0.8', '0.35', '1.54', '-0.99', '-0.35', '-0.28', '0.45',
'-0.04', '-0.06', '0.02', '0.58', '-0.32', '-0.1', '0.28',
'0.3', '-0.36', '0.81', '0.79', '0.21', '1.81', '0.19', '0.84',
'0.2', '-0.06', '-0.11', '-1.4', '-2.08', '0.88', '-0.14',
'-0.96', '1.3', '0.06', '-0.37', '1.49', '-0.91',
'1.14', '-1.05', '1.49', '-0.79', '2.02', '0.38', '2.4', '1.25',
'0.5', '1.11', '-0.54', '-0.1', '0.63', '1.01')
num <- as.numeric(unlist(data))
shapiro.test(num)
shapiro.test
【问题讨论】：
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在您的笔记本中，创建新单元并运行
!pip install rpy2，它将安装包，您将不必使用 conda。我在 conda 遇到过这种问题。 -
此终端窗口仅用于输出内容，不用于输入。如果您没有看到提示（以 >、$、[] 等开头的行），您可以预期这仅用于查看消息。
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你真的想用 R 和 python 环境建立一个多语言笔记本系统来读取数字向量吗？使用
readr::write_lines导出R 中的数据并使用[float(x) for x in open("foo.txt", "r").readlines()]在python 中读取文件。它要简单得多。 Jupyter 并非旨在轻松使用多种语言，而语言旨在仅读取文本文件。 -
请告诉我你要使用的python函数。混合语言并非易事。顺便说一句：
rpy2也要求您安装 R。这必须在 juptyter 内核中可以访问。 -
你需要写
%%R -o data data <- list(1,2,3)而不是-i，因为数据是一个R输出。您也可以使用 IRkernel 在 jupyter 中仅使用 R。为什么要强制使用python？
标签： python r jupyter-notebook