打开时，Rstudio 启动许多进程（在上一个会话中从并行包开始）——如何杀死它们？

Question

我已经阅读了这个 SO 问题和答案 (R parallel computing and zombie processes)，但它似乎并不能完全解决我的情况。

我有一台运行 Mac OS X 10.10.3、R 3.2.0 和 RStudio 0.99.441 的 4 核 MacBook Pro。

昨天，我正在试用“foreach”和“doParallel”包（我想在我正在开发的包中使用它们）。我这样做了：

cl <- makeCluster(14)
registerDoParallel(cl)

a <- 0
ls <- foreach(icount(100)) %dopar% {
    b <- a + 1
}

我很清楚，在我的 4 核机器上拥有 14 个进程没有意义，但该软件实际上将在 16 核机器上运行。这时我的电脑停了下来。我打开活动监视器，发现 16 个（或更多，也许？）R 进程。我试图强迫他们从活动监视器中退出——没有运气。我关闭了 RStudio，这杀死了所有的 R 进程。我重新打开了 RStudio 并重新启动了所有 R 进程。我重新启动计算机并重新启动 RStudio，然后重新启动所有 R 进程。

如何在不重新启动所有这些进程的情况下启动 RStudio？

编辑：我忘了提到我还重建了我当时正在处理的包（所有进程可能在构建期间一直在运行）

EDIT2：另外，我不能 StopCluster(cl) 因为 cl 不再在环境中...我关闭了那个 R 会话。

EDIT3：当我打开 R.app（R 提供的 R GUI）或在终端中打开 R 时，不会出现此类问题。所以我觉得肯定是RStudio相关的。

EDIT4：在打开 RStudio 和启动所有这些不需要的进程之间似乎存在随机延迟。 15 秒到 2 分钟之间。

EDIT5：似乎只有在我打开启动它们的项目后才会启动这些进程。

EDIT6：我一直在 .Rproj.user 文件中挑选要删除的内容。我删除了 ctx、pcs 和 sdb 中的所有文件（但没有删除目录）。问题仍然存在。

EDIT7：当我在命令行运行“killall R”时，它会杀死所有这些进程，但是当我重新启动 RStudio 并重新打开项目时，所有进程都会重新启动。

EDIT8：我使用“killall -s R | wc -l”发现R进程的数量在项目打开时不断增长。它升至 358，然后我运行“killall R”，因为我的计算机发出可怕的声音。

EDIT9：RStudio 目前完全无法使用。每次我“killall R”时，它都会在 15 秒内重新启动所有进程。

EDIT10：当我启动一个同时启动大量 R 进程的构建时——最后一次检查为 109。当构建显示“为延迟加载准备包”时，这些过程都会启动。此时计算机几乎停止运行。

EDIT11：我删除了 .Rproj 文件（实际上只是将其作为备份移动）和 .Rproj.user 目录。我在 RStudio 中使用了“从目录创建项目”。当我打开那个新项目时，我仍然得到相同的行为。当我打开一个不包含在 .Rproj 文件或 .Rproj.user 目录中的任何地方的项目时，RStudio 会做什么！？我花了一整天的时间来解决这个问题....:(

Answer 1

最好的猜测——最新版本的 RStudio 试图在幕后做一些工作来开发一个自动完成数据库，基于它在项目中打开的文件中检测到的 library() 和 require() 调用。为此，它启动新的 R 进程，加载这些包（使用 library()），然后返回该包提供的所有对象的集合。

您是否正在加载某些具有复杂.onLoad() 操作的包？ RStudio 中的这个引擎有可能在幕后运行 R 进程中的引擎，但由于某种原因卡住了，让您使用这些（可能是陈旧或繁忙的）R 进程。

作为参考，here 报告了一些类似的问题。

Answer 2

以下是最终修复它的原因：

删除我构建的包（二进制文件，我相信...我在 RStudio 的“包”部分中单击了其名称右侧的“x”）。

重建它，用

library(parallel)

注释掉了。

Answer 3

unloadNamespace("doParallel")

将杀死registerDoParallel启动的无名工人

如果你有集群的名字，你可以使用：

stopCluster(cl)