使用字符串在R中搜索文件夹并导入文件答案

【问题标题】：Use string to search folder and import file in R使用字符串在R中搜索文件夹并导入文件
【发布时间】：2021-10-18 18:50:45
【问题描述】：

我正在尝试搜索文件夹并根据字符值导入多层栅格。

如何导入与字符串匹配的文件并保留其名称？

#use shp and y to find orthos
ortho <- crop(MrSID_shp, y)
s <- ortho[[2]] 
s
#"3_5" "2_5"

#use s values to search folder with corresponding name
file.is <- Sys.glob("*.tif")
print(file.is) # "0_0.tif" "2_5.tif" "3_5.tif"

for (i in seq_along(file.is)){
file.is[[i]] <- stack(file = file.is[i],
                      pattern = s,)
}
#this results in empty values

我尝试了 grep、find 和 lapply，但都没有成功。我已经能够使用“s”模式导入“3_5.tif”，但我需要导入所有匹配的文件，而不仅仅是一个。

谢谢

【问题讨论】：

标签： r regex find glob

【解决方案1】：

以下适用于您的示例（我手动创建了file.is，您希望在其中使用Sys.glob("*.tif")）：

s <- c("2_5", "3_5")
file.is <- c("0_0.tif", "2_5.tif", "3_5.tif")

unique(sapply(s, grep, file.is, value = TRUE))

【讨论】：

谢谢你，迈克，成功了！您能否就导入这些具有不同范围的文件的最佳方式提出建议？不确定这是否需要一个新的 Question.toimport <- unique(sapply(s, grep, file.is, value = TRUE)) | stack(toimport) 不起作用。谢谢！
很高兴它成功了！当您说“范围”时，您是指地理范围（即，为不同的数据集获取s）？（PS如果答案有效，您介意接受答案吗？）
接受 - 谢谢！不是s。当我去阅读stack(toimport) #Error in compareRaster(rasters) : different extent。我不知道在这里做什么，我已经阅读了掩码、分解和重新采样以更改toimport 中列出的文件的范围，但我不确定哪个最好使用。我希望我不需要改变范围。导入这些 tif 后，我将使用 shapefile 裁剪它们。有什么路线可以推荐吗？谢谢
我试过resample(toimport) # Error in (function (classes, fdef, mtable) : unable to find an inherited method for function ‘resample’ for signature ‘"character", "missing"’。我假设因为toimport 是一个字符向量，我不能使用它来选择要导入的文件。感谢您的所有帮助！
@Jade，这是有道理的。我认为值得发布一个不同的问题。不过，它帮助我从功能的角度进行思考。如果您可以编写一个对单个实体执行所需操作的函数，那么您始终可以使用apply 系列遍历它们。