R bookdown：'r'块块来自'python'块的图形输出答案

【问题标题】：R bookdown: 'r' chunk blocks graphic output from 'python' chunkR bookdown：'r'块块来自'python'块的图形输出
【发布时间】：2021-07-30 00:41:09
【问题描述】：

两个 {python} 块使用 matplotlib 生成绘图。如果我在它们之间放置一个 {r} 块，则 knitr 将第一个图替换为第二个。有人知道如何解决此问题吗？

最小示例 Rmd 文件：

--- 
title: "Error demo"
date: "`r Sys.Date()`"
---
    
```{r setup, include=FALSE}
library(reticulate)
use_condaenv('/Users/XXXX/opt/anaconda3/envs/r-env1', required = TRUE)
```
    
```{python, echo=FALSE}
import matplotlib.pyplot as plt
plt.plot([4,1,2,0],'r-')
```
    
```{r, echo = FALSE}
# an r chunk between the python chunks suppresses the first plot
```
    
```{python, echo=FALSE}
plt.plot([0,2,1,4],'g-')
```

构建输出包含第二个绘图的两个版本。这是 HTML 输出的相关部分：

<div id="header">
<h1 class="title">Error demo</h1>
<p class="date" style="margin-top: 1.5em;"><em>2021-05-07</em></p>
</div>
<p><img src="MIB-R_files/figure-html/unnamed-chunk-1-1.png" width="672" /></p>
<p><img src="MIB-R_files/figure-html/unnamed-chunk-1-1.png" width="672" /></p>

版本信息：

MacOS：达尔文 20.3.0
Python：3.9.2 |由 conda-forge 打包
RStudio：1.4.1106
降价：2.8
针织机：1.33
网状：1.20

【问题讨论】：

您是否尝试为每个块指定唯一标识符，即{r c1, echo = FALSE}
刚刚试了一下，结果一样。

标签： python r r-markdown knitr bookdown

【解决方案1】：

通过重建整个 R 环境解决了这个问题。现在我的 bookdown 项目构建良好。也许包之间存在一些冲突。如果您遇到类似的问题，这里是我当前的 R 包版本列表：

askpass 1.1 base64enc 0.1-3 BH 1.72.0-3 bookdown 0.21.6 brew 1.0-6 brio 1.1.2 bslib 0.2.4 cachem 1.0.4 callr 3.7.0 cli 2.5.0 clipr 0.7.1 commonmark 1.7 crayon 1.3.4 凭证 1.3.0 curl 4.3 desc 1.3.0 devtools 2.4.1 diffobj 0.3.4 摘要 0.6.27 省略号 0.3.1 评估 0.14 fansi 0.4.2 fastmap 1.1.0 fs 1.5.0 gert 1.3.0 gh 1.3。 0 gitcreds 0.1.1 胶水 1.4.2 highr 0.8 htmltools 0.5.1.1 httpuv 1.5.4 httr 1.4.2 ini 0.3.1 jquerylib 0.1.3 jsonlite 1.7.2 knitr 1.30.4 后来 1.1.0.1 生命周期 0.2.0 magrittr 2.0。 1 markdown 1.1 memoise 2.0.0 mime 0.9 openssl 1.4.3 packrat 0.6.0 支柱 1.6.0 pkgbuild 1.2.0 pkgconfig 2.0.3 pkgload 1.2.1 png 0.1-7 赞美 1.0.0 prettyunits 1.1.1 processx 3.5.2 承诺 1.1.1 ps 1.6.0 purrr 0.3.4 R6 2.5。 0 rappdirs 0.3.1 rcmdcheck 1.3.3 Rcpp 1.0.5 rematch2 2.1.2 遥控器 2.3.0 renv 0.13.2 reticulate 1.18-9000 rlang 0.4.9 rmarkdown 2.6.0003 roxygen2 7.1.1 rprojroot 2.0.2 rstudioapi 0.8.16 0.13 rversions 2.0.2 sass 0.3.1 sessioninfo 1.1.1 shiny 1.6.0 sourcetools 0.1.7 stringi 1.5.3 stringr 1.4.0 sys 3.4 testthat 3.0.2 tibble 3.1.1 tinytex 0.28 usethis 2.0.1 utf8 1.2.1 vctrs 0.3.8 waldo 0.2.5 晶须 0.4 withr 2.3.0 xfun 0.19 xml2 1.3.2 xopen 1.0.0 xtable 1.8-4 yaml 2.2.1 zip 2.1.1

【讨论】：