在基于 ggplot2 的绘图函数中创建构面时出错

Question

所以我正在尝试为现有的 R 包开发基于ggplot2的绘图功能。用户应该能够指定一个数据框（datfile），一个垂直线放置在图中的值（alpha），以及一个用于通过分面创建子图的分组变量（group）。

以下是一些示例数据：

#Some hypothetical data
Computed=c(0.03, 0.25, 0.74, 0.02, 0.0023, 0.43, 0.56, 0.32, 0.005, 0.0032, 0.06)
Reported.P.Value=c(0.25, 0.24, 0.74, 0.01, 0.001, 0.40, 0.56, 0.32, 0.003, 0.0032, 0.02)
Journal=c("a", "b","a", "b","a", "b","a", "b","a", "b","a")

dat=data.frame(Computed, Reported.P.Value, Journal)

函数如下所示：

plot1 <- function(datfile, alpha, group){

p <- ggplot(datfile, aes(y = Computed,x = Reported.P.Value))   

p + geom_point(size=2.5)+
  geom_vline(xintercept=alpha, color="grey60",linetype="dashed")+
  geom_abline(intercept=0, slope=1, color="grey60")+
  annotate("text", x= 0.5, y = .10, label="overestimated")+
  annotate("text", x= 0.5, y = .90, label="underestimated")+
  scale_x_continuous(name="Reported p-values", breaks=c(0.00, 0.05, 0.10, 0.25, 0.50, 0.75, 1.0))+
  scale_y_continuous(name="Computed p-values", breaks=c(0.00, 0.05, 0.10, 0.25, 0.50, 0.75, 1.0))+
  facet_grid(group ~ .)
 }

如果我忽略该函数，只自己执行绘图代码（从数据框中替换适当的向量），一切正常：

但是如果尝试运行绘图函数本身的函数...：

plot1(dat, 0.05, Journal)

我收到以下错误消息： Error in layout_base(data, rows, drop = drop) : At least one layer must contain all variables used for faceting

我的错误似乎与here 讨论的问题有关，接受答案的作者写道：

facet_grid 是更特殊的必需名称，甚至不是其功能。

这是否意味着我无法将数据框中的变量传递给函数中的 faceting 选项？我的编程背景并不出色，如果我的函数的用户无法指定分面变量，那将是一个真正的遗憾。非常感谢任何帮助！

Answer 1

对原始代码的两个更改：使用paste 将构面语句传递给facet_grid 以构造适当的字符串（根据@aosmith 的评论，不需要公式包装器），然后将构面变量传递给函数一个字符串。

plot1 <- function(datfile, alpha, group){

  p <- ggplot(datfile, aes(y = Computed,x = Reported.P.Value))   

  p + geom_point(size=2.5)+
    geom_vline(xintercept=alpha, color="grey60",linetype="dashed")+
    geom_abline(intercept=0, slope=1, color="grey60")+
    annotate("text", x= 0.5, y = .10, label="overestimated")+
    annotate("text", x= 0.5, y = .90, label="underestimated")+
    scale_x_continuous(name="Reported p-values", breaks=c(0.00, 0.05, 0.10, 0.25, 0.50, 0.75, 1.0))+
    scale_y_continuous(name="Computed p-values", breaks=c(0.00, 0.05, 0.10, 0.25, 0.50, 0.75, 1.0))+
    facet_grid(paste(group, "~ ."))
}

plot1(dat, 0.5, "Journal")