【发布时间】:2021-07-09 05:46:22
【问题描述】:
我正在使用 R 绘制一个上调/下调的基因计数矩阵,其中 y 轴是类别,x 轴是每个处理中的计数。这是我用 corrplot 绘制的矩阵结构的示例:
corrplot 的矩阵图
我希望每个单元格都有一个分割圆图,而不是像上图那样在每个单元格中绘制完整的圆圈。一半包含类型“up”值,另一半包含“down”值。
使用这个帖子作为example 的圆形图,我已经能够绘制圆圈,但我正在努力将它变成一个类似矩阵的图形。以下是一些示例数据:
df <- data.frame(category = rep(c("A", "B"), each = 2),
type = rep(c("up", "down"), 4),
treatment = rep(c("treat1", "treat2", "treat3", "treat4"), each = 4),
count = c(19419, 1132, 8138, 947, 8349, 436, 789, 1580))
df$treatment <- as.factor(df$treatment)
library(ggplot2)
ggplot(df, aes(x=category, y=sqrt(count), fill=type)) + geom_col(width =1) +
coord_polar(theta = "x", direction = -1) +
facet_wrap(category~treatment) +
theme_void()
如何将这些圆圈排列成类似矩阵的图形?如何在矩阵的每个单元格内绘制分割圆?
任何建议将不胜感激。非常感谢!!
【问题讨论】:
标签: r ggplot2 matrix r-corrplot ggcorrplot