R plotly scatter3d：如何使最近的标记出现最大？答案

【问题标题】：R plotly scatter3d: How to make nearest marker appear the biggest?R plotly scatter3d：如何使最近的标记出现最大？
【发布时间】：2021-09-03 18:33:45
【问题描述】：

目前我的代码如下所示：

library(plotly)

count = data.frame(
    row.names = c("Cell1", "Cell2", "Cell3", "Cell4", "Cell5", "Cell6"),
    Gene1 = c(10, 11, 8, 3, 2, 1),
    Gene2 = c(6, 4, 5, 3, 2.8, 1),
    Gene3 = c(12, 9, 10, 2.5, 1.3, 2),
    Gene4 = c(5, 7, 6, 2, 4, 7),
    
    stringsAsFactors = FALSE
)

threeD = plotly::plot_ly(
    data = count,
    x = ~Gene1,
    y = ~Gene2,
    z = ~Gene3,
    type = "scatter3d",
    mode = "markers",
    marker = list(size = 20),
    color = row.names(count)
)
threeD

此代码生成以下输出：

我想让标记随距离缩放。因此，离“我”最近的标记更大（Cell1 和 Cell 2），而远离“我”的标记显得更小（Cell5 和 Cell6）。这将实现更逼真的 3D 感觉。

【问题讨论】：

标签： r plot plotly bioinformatics scatter3d

【解决方案1】：

可以通过为标记分配大小列表来制作一种“气泡”图，以便它们根据各自沿 z 轴的值增长。最简单的方法是重用相同的数据并根据需要应用一些缩放功能（产品、日志等），例如：

marker = list(size = c(12, 9, 10, 2.5, 1.3, 2)*5)

问题在于，如果您改变观点，标记将不会神奇地更新为预期的 3D 感觉。

您还可以通过将colorscale 属性添加到标记对象来使用颜色缩放，例如：

colorscale = c('#FFE1A1', '#683531')

【讨论】：

比你！要去试试这个！ :)