错误：“RevoUtilsMath”的包或命名空间加载失败答案

【问题标题】：Error: package or namespace load failed for 'RevoUtilsMath'错误：“RevoUtilsMath”的包或命名空间加载失败
【发布时间】：2018-12-16 06:05:00
【问题描述】：

我对这个问题有点疯狂。我正在尝试在我家的集群中的环境（python 2.7）中使用 conda 安装 R 包（即没有 root 权限）。我首先在我的环境中安装了 R：

conda install -c r r=3.4

然后：

conda install -c conda-forge python-igraph

（因为我感兴趣的库需要 igraph）

最后：

conda install -c conda-forge r-diffusionmap

不幸的是，当我启动 R 时，出现以下消息：

错误：“RevoUtilsMath”的包或命名空间加载失败：.onLoad 'RevoUtilsMath' 的 loadNamespace() 失败，详细信息：调用：NULL
错误：删除 Microsoft R，然后重新安装。一定要选择MKL 库作为安装选项。

在启动期间 - 警告消息：包“RevoUtils”是在 R 版本 3.4.3 下构建的

这是什么意思？我该如何解决这个问题？

提前谢谢你

【问题讨论】：

您没有说出您要运行的 R 版本，但您的库中似乎有一个为不兼容版本构建的包。您可以按照消息中的说明进行操作（重新安装 Microsoft R），或者删除软件包以及依赖它的所有内容。
我刚刚使用指定的 r 版本进行了编辑
R 没有 3.4 版本（版本有 3 个部分，如 3.4.3）。我不知道conda 或者根据该规范它会选择安装什么。
conda 在未指定任何内容时采用默认的 3.4.3。采用最后一个版本。
您使用的包是在 3.4.3 下构建的，但是您运行的 R 是不同的版本。所以conda 可能没有按照你的想法做。（或者，也许微软在不更改版本号的情况下搞砸了。）

标签： r conda

【解决方案1】：

在我的根 R 中安装了一些库（包括 Rcpp）后，我遇到了同样的问题，但不是我的 conda 环境（搞砸了 conda）。任何时候打开运行 R 的 jupyter notebook 都会导致内核死机。

我的解决方法是：

Uninstall Anaconda3
重新安装 Anaconda3
重新安装我需要的所有库（主要是 R 中的 Bioconductor）

出现了一些其他问题，例如包不一致，但我按照here 的描述处理了这些问题。

【讨论】：

【解决方案2】：

conda-forge（或Bioconda）上的所有 R 包都针对单个版本或R 编译每个新版本分支（通常从补丁 1 开始，因此 3.x.1，3.4.3 除外）。这是由于 ABI 不兼容问题造成的。

还要注意defaults 和conda-forge 频道是（其中）not binary compatible（尽管现在是they should be）。并且自 2018 年以来，默认 anaconda 频道将 Microsoft R Open 分发为default R，是否所有来自 conda-forge 的包都应该最好与来自 conda-forge 的 R 一起使用。

您应该可以通过使用conda install -c conda-forge r-base 安装R 来解决此问题。

【讨论】：

【解决方案3】：

我在ubuntu平台（18.4）打开R运行代码时出现同样的错误信息，没有其他有用的方法可以解决。我的R版本是3.4.3.enter image description here

【讨论】：

对不起，这是我的错。应该是评论。