Anaconda 和 Brew 的最佳实践

Question

我刚买了一台装有 OSX Sierra 的新 Macbook，所以想确保我的开发环境设置正确。

我希望遵循此处提到的“最佳实践”：https://github.com/nicolashery/mac-dev-setup

我需要 Python 2.x 来工作（urllib、Pandas、Numpy、Scikit-learn），而 Python 3.x 需要我正在学习的一些在线课程（Pandas、Numpy、Django）。 我已经安装了 Python 2 和 3，分别使用 brew install python 和 brew install python3。

但是，在这个链接上，没有提到 Anaconda，只有 IPython。 鉴于我已经通过 Homebrew 安装了 Python 2 和 3，是否建议使用 anaconda，或者我应该坚持使用上面 Github 链接中提到的标准 IPython？ 看完这篇文章我很困惑：OS X - Deciding between anaconda and homebrew Python environments

如果 Brew 和 Anaconda 确实可以一起工作，我可以采取哪些具体步骤来确保两个版本之间没有冲突？

Answer 1

brew 和conda 往往不能很好地配合使用，但我认为我的设置到目前为止对我来说效果很好。它的灵感来自this post。

您可以将以下代码添加到您的.zshrc：

# Deactivates conda before running brew. 
# Re-activates conda if it was active upon completion.

brew() {
    local conda_env="$CONDA_DEFAULT_ENV"
    while [ "$CONDA_SHLVL" -gt 0  ]; do
        conda deactivate
    done
    command brew $@
    local brew_status=$?
    [ -n "${conda_env:+x}" ] && conda activate "$conda_env"
    return "$brew_status"
}

您想在运行brew 之前停用conda，以便brew 在尝试安装某些东西时在您的PATH 中找不到conda 包。事实上，brew doctor 会抱怨如果您在运行 brew 之前没有停用 conda，正如我在上面链接到的帖子中提到的那样。 （另见this question。）

我应该提到的一件事是conda 环境“堆栈”，但我上面编写的brew() 函数不会跟踪您的环境堆栈。 （有关跟踪此功能的版本，请参见下文。）例如，如果您在conda 环境oldenv 处于活动状态时执行conda activate newenv，则conda deactivate 会将您返回到oldenv。但是，如果您在激活oldenv 和newenv 之后使用我上面编写的函数运行brew，则运行conda deactivate 不会让您返回oldenv，而是会完全停用您的conda 环境。

这个函数在运行brew 时也可能会产生一些不必要的开销，因为我相信你只需要在运行brew install 时关闭你的conda 环境。也就是说，如果你是那种足够关心开销的人，那么这个答案可能不会告诉你任何你不知道的事情。

最后一点，brew cask install anaconda 在我看来并不是一个好主意，因为 conda 被设计为安装在 $HOME 中，但 brew cask 将希望将其安装在 /usr/local 中，这样可能导致不可预测的行为。

编辑：这里是 brew 函数的一个版本，它让你的 conda 环境保持原样：

brew() {
    local -a conda_envs
    while [ "$CONDA_SHLVL" -gt 0  ]; do
        conda_envs=("$CONDA_DEFAULT_ENV" $conda_envs)
        conda deactivate
    done
    command brew $@
    local brew_status=$?
    for env in $conda_envs; do
        conda activate "$env"
    done
    unset env
    return "$brew_status"
}

我已经在 Zsh 中对此进行了测试。我认为它不会在 Bash 中工作。如果您想在 Bash 中使用它，您需要将 for 循环声明更改为类似 for env in ${conda_envs[@]} 的内容。但是，我没有对此进行测试，因此请在使用前测试它是否能满足您的需求。

Answer 2

我是 python 新手，在安装 python 时遇到了问题。我在我的 Mac 上安装了来自 homebrew 和 anaconda 的 python。我的 anaconda 安装弄乱了我对 vim 和 MacVim 的自制 python 依赖项。

我的解决方案是每当我通过自制软件安装/更新软件包时，我都会从我的 PATH 中删除 anaconda。这有点痛苦，但我只是偶尔通过自制软件安装/更新软件包，所以没关系。

要在 python 2 和 3 之间切换，这是我在终端中的命令：

$ conda search python
...
...
$ conda install python=3.5.0

$ conda info -e
# conda environments:
#
py27                     /Users/apollotang/opt/local/anaconda2/envs/py27
py36                     /Users/apollotang/opt/local/anaconda2/envs/py36
root                  *  /Users/apollotang/opt/local/anaconda2

$ source activate py36      ### <——— here is the command in to change python version 
(py36) $ conda info -e
# conda environments:
#
py27                     /Users/apollotang/opt/local/anaconda2/envs/py27
py36                  *  /Users/apollotang/opt/local/anaconda2/envs/py36
root                     /Users/apollotang/opt/local/anaconda2

(py36) $ python -V
Python 3.6.2 :: Anaconda custom (x86_64)

我发现这个命令来自 How to change default Anaconda python environment 和 http://chris35wills.github.io/conda_python_version/

另外，这里有一篇关于在 mac 上设置 python 环境的最佳实践的非常好的文章 https://www.davidculley.com/installing-python-on-a-mac/

Answer 3

安装anaconda 意味着您不需要系统Python（将其留给系统，因为您可能不想更改它），或者homebrew 安装的Python。

当您创建 conda 环境时，您可以指定您希望它使用的 Python 版本。例如：

$ conda create --name myenv python=3.5

激活conda 环境（在上述命令之后，您将使用conda activate myenv 或source activate myenv 执行此操作，对于早期版本）自动意味着python 命令将运行您为该环境选择的Python 解释器.可以使用pip 和conda install 安装软件包，并且与conda 环境非常兼容。

Answer 4

您可以设置一个虚拟环境 (virtualenv) 并为每个环境分配不同的 Python 版本，这样就不会有任何重叠导致依赖问题。

查看“Python Hitchhiker 指南”了解如何完成设置。

http://docs.python-guide.org/en/latest/dev/virtualenvs/

Answer 5

如果使用 .bash，以下将在运行 brew 命令时暂时停用 anaconda 环境。 （见原zshpost）

第一步

$ vim ~/.bash_profile

--添加--

if [ -f ~/.bashrc ]; then
    source ~/.bashrc
fi

第二步

$ vim ~/.bashrc

--添加--

# Temporarily deactivates anaconda environment to run brew command(s)

brew() {(
    local conda_env="$CONDA_DEFAULT_ENV"
    while [ "$CONDA_SHLVL" -gt 0  ]; do
        conda deactivate
    done
    command brew $@
    local brew_status=$?
    return "$brew_status"
)}