将 Conda 环境与 Jupyter Notebook 链接答案

【问题标题】：Link Conda environment with Jupyter Notebook将 Conda 环境与 Jupyter Notebook 链接
【发布时间】：2016-09-22 20:02:39
【问题描述】：

我正在尝试为使用 python 做一些科学工作创造一个良好的环境。为此，我安装了 Jupyter 和 miniconda。

然后我希望能够拥有不同的环境并将它们与 Jupyter 笔记本一起使用。所以我用 conda 创建了两个自定义环境：py27 和 py35。

> conda env list
# conda environments:
#
py27                     /Users/***/miniconda3/envs/py27
py35                     /Users/***/miniconda3/envs/py35
root                  *  /Users/***/miniconda3

然后在我的笔记本上我有两个内核python 2 和python 3。在笔记本中，我使用 python3 内核得到以下信息：

> import sys
> print(sys.executable)
/Users/***/miniconda3/envs/py35/bin/python

这与 python2 内核：

> import sys
> print(sys.executable)
/usr/local/opt/python/bin/python2.7

如何将sys.executable 设置为 python2 的 miniconda env？
如何将 conda env 与笔记本内核绑定？
source activate py35 是否有与jupyter notebook 的链接？

我想我真的错过了什么。

谢谢大家。

--- 编辑

我有多个 jupyter bin ：

> where jupyter
/usr/local/bin/jupyter
/usr/local/bin/jupyter
/Users/ThomasDehaeze/miniconda3/bin/jupyter

我这里只有一个内核/usr/local/share/jupyter/kernels/python2。但是在 Jupyter 内部，我有两个内核，python2 和 python3。我在哪里可以找到另一个？

我从/usr/local/share/jupyter/kernels/python2修改了kernel.json：

{
 "display_name": "Python 2",
 "language": "python",
 "argv": [
  "/Users/***/miniconda3/envs/py27/bin/python2.7",
  "-m",
  "ipykernel",
  "-f",
  "{connection_file}"
 ]
}

然后：

import sys
print(sys.executable)
/usr/local/opt/python/bin/python2.7

所以一切都没有改变

【问题讨论】：

这可能会有所帮助，允许您选择在 ipython 中运行内核的环境：groups.google.com/a/continuum.io/forum/m/#!topic/anaconda/…
谢谢，我会调查的
在此处查看我的答案：stackoverflow.com/questions/30492623/… - 您可能希望将提示与 --name 参数一起使用。
另见：stackoverflow.com/questions/58068818/…

标签： python ipython jupyter jupyter-notebook miniconda

【解决方案1】：

对于 Anaconda，我建议您使用更简单、更合适的解决方案；看看nb_conda_kernels package。

它允许您“在 Jupyter Notebook 中管理基于 conda 环境的内核”。

从 Anaconda 版本 4.1.0 起应包含，否则只需使用

conda install nb_conda

现在您应该可以从 Notebook 界面直接管理所有内容了。

【讨论】：

这个包很好用！您只需在激活环境时安装它。该环境立即显示在笔记本的新菜单选择中。因此，您必须对要添加到列表中的每个环境执行此操作。
安装 nb_conda 的缺点是 conda 环境混乱。有解决办法吗？
@Quickbeam2k1 您只需将其安装到运行 Jupyter 笔记本的环境中。这允许您将 Jupyter 安装到根环境中并在各种其他环境中运行笔记本，而无需在每个环境中都安装 Jupyter。
他们改变了什么吗？上次我尝试这个时，由于 nb_conda 内核与 Jupyter 的依赖关系，这是不可能的。
正如我今天（2018 年 2 月 1 日）所尝试的，在 root env 中安装 nb_conda 后，所有 envs 都会出现在 Jupyter notebook 文件浏览器的内核列表中，无需在其他 env 中安装 nb_conda_kernels。

【解决方案2】：

假设你的 conda-env 被命名为cenv，它很简单：

    $ conda activate cenv
    (cenv)$ conda install ipykernel
    (cenv)$ ipython kernel install --user --name=<any_name_for_kernel>
    (cenv($ conda deactivate

如果您重新启动 jupyter notebook/lab，您将能够看到可用的新内核。

PS：如果您使用的是 virtualenv 等，上述步骤也适用。

【讨论】：

这就是我一直使用它的方式。但是，当我在 conda 环境中使用 openjdk 时，我无法让它工作。 JAVA_HOME 通常在 env 被激活时设置。当我将它安装为 ipython 内核时，这不会发生。对这种情况有什么想法吗？

【解决方案3】：

不确定还有什么帮助，但对我来说至关重要的是在根 conda 环境中安装 nb_conda_kernels。尝试在特定的 conda 环境中安装它并没有让 Jupyter Notebook 能够使用默认环境以外的其他 conda 环境。

conda install -n root nb_conda_kernels

jupyter notebook

【讨论】：

是的。我也必须这样做，虽然这有点违反直觉，因为 nb_conda 只应该作为内核进入你想要的环境中。

【解决方案4】：

我找到了解决方案。内核的设置位于此处~/Library/Jupyter/kernels/。

然后我修改了kernel.json文件，并将正确的路径设置为python。

现在它正在工作。

【讨论】：

【解决方案5】：

这对我有用：

source activate {environment_name}
python -m ipykernel install --user --name={environment_name};

如果没有安装 ipykernel，请使用以下命令：

conda install -c anaconda ipykernel

【讨论】：

【解决方案6】：

对我有用的是：创建虚拟环境，安装 ipykernel，在 jupyter 内核中注册虚拟环境并加载 jupyter notebook：

$ conda create -n testEnv python=3.6
$ conda activate testEnv
(testEnv)$ conda install ipykernel
(testEnv)$ ipython kernel install --user --name=testEnv
(testEnv)$ jupyter notebook

在此之后，在 jupyter notebook 中，您应该能够在其他内核列表中找到创建的环境

【讨论】：