我想按多列对数据框进行排序。例如，对于下面的数据框，我想按列“z”（降序）排序，然后按列“b”（升序）：
dd <- data.frame(b = factor(c("Hi", "Med", "Hi", "Low"),
levels = c("Low", "Med", "Hi"), ordered = TRUE),
x = c("A", "D", "A", "C"), y = c(8, 3, 9, 9),
z = c(1, 1, 1, 2))
dd
b x y z
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4 Low C 9 2
【问题讨论】：
dplyr 中的arrange() 是我最喜欢的选项。使用管道运算符，从最不重要的方面到最重要的方面
dd1 <- dd %>%
arrange(z) %>%
arrange(desc(x))
【讨论】：
如果 SQL 对您来说很自然，sqldf 包会按照 Codd 的意图处理 ORDER BY。
【讨论】：
order 来自base
arrange 来自dplyr
setorder 和 setorderv 来自 data.table
arrange 来自plyr
sort 来自taRifx
orderBy 来自doBy
sortData 来自Deducer
大多数时候您应该使用dplyr 或data.table 解决方案，除非没有依赖关系很重要，在这种情况下使用base::order。
我最近将 sort.data.frame 添加到 CRAN 包中，使其类兼容，如下所述： Best way to create generic/method consistency for sort.data.frame?
因此，给定data.frame dd，可以如下排序：
dd <- data.frame(b = factor(c("Hi", "Med", "Hi", "Low"),
levels = c("Low", "Med", "Hi"), ordered = TRUE),
x = c("A", "D", "A", "C"), y = c(8, 3, 9, 9),
z = c(1, 1, 1, 2))
library(taRifx)
sort(dd, f= ~ -z + b )
如果您是此功能的原作者之一，请与我联系。关于公共领域的讨论在这里：https://chat.stackoverflow.com/transcript/message/1094290#1094290
您还可以使用 plyr 中的 arrange() 函数，正如 Hadley 在上述线程中指出的那样：
library(plyr)
arrange(dd,desc(z),b)
基准测试：请注意，我在新的 R 会话中加载了每个包，因为存在很多冲突。特别是加载 doBy 包会导致 sort 返回“以下对象被'x（位置 17）'屏蔽：b、x、y、z”，并且加载 Deducer 包会覆盖来自 Kevin 的 sort.data.frame Wright 或 taRifx 包。
#Load each time
dd <- data.frame(b = factor(c("Hi", "Med", "Hi", "Low"),
levels = c("Low", "Med", "Hi"), ordered = TRUE),
x = c("A", "D", "A", "C"), y = c(8, 3, 9, 9),
z = c(1, 1, 1, 2))
library(microbenchmark)
# Reload R between benchmarks
microbenchmark(dd[with(dd, order(-z, b)), ] ,
dd[order(-dd$z, dd$b),],
times=1000
)
中位时间：
dd[with(dd, order(-z, b)), ]778
dd[order(-dd$z, dd$b),]788
library(taRifx)
microbenchmark(sort(dd, f= ~-z+b ),times=1000)
中位时间：1,567
library(plyr)
microbenchmark(arrange(dd,desc(z),b),times=1000)
中位时间：862
library(doBy)
microbenchmark(orderBy(~-z+b, data=dd),times=1000)
中位时间：1,694
请注意，doBy 需要花费大量时间来加载包。
library(Deducer)
microbenchmark(sortData(dd,c("z","b"),increasing= c(FALSE,TRUE)),times=1000)
无法加载 Deducer。需要 JGR 控制台。
esort <- function(x, sortvar, ...) {
attach(x)
x <- x[with(x,order(sortvar,...)),]
return(x)
detach(x)
}
microbenchmark(esort(dd, -z, b),times=1000)
由于附加/分离，似乎与微基准测试不兼容。
m <- microbenchmark(
arrange(dd,desc(z),b),
sort(dd, f= ~-z+b ),
dd[with(dd, order(-z, b)), ] ,
dd[order(-dd$z, dd$b),],
times=1000
)
uq <- function(x) { fivenum(x)[4]}
lq <- function(x) { fivenum(x)[2]}
y_min <- 0 # min(by(m$time,m$expr,lq))
y_max <- max(by(m$time,m$expr,uq)) * 1.05
p <- ggplot(m,aes(x=expr,y=time)) + coord_cartesian(ylim = c( y_min , y_max ))
p + stat_summary(fun.y=median,fun.ymin = lq, fun.ymax = uq, aes(fill=expr))
（线从下四分位延伸到上四分位，点是中位数）
鉴于这些结果并权衡简单性与速度，我不得不向plyr 包中的arrange 表示赞同。它具有简单的语法，但几乎与带有复杂机制的基本 R 命令一样快。通常出色的哈德利·威克姆（Hadley Wickham）作品。我唯一的抱怨是它打破了标准 R 命名法，其中排序对象由sort(object) 调用，但我理解为什么 Hadley 这样做是因为上面链接的问题中讨论的问题。
【讨论】：
taRifx::autoplot.microbenchmark使用。
b 在示例中的排序方式。默认是升序排序，所以你不要把它包装在desc中。两者都升序：arrange(dd,z,b)。两者都降序：arrange(dd,desc(z),desc(b))。
?arrange：“# 注意：plyr 函数不保留 row.names”。如果想要保留row.names，这使得出色的arrange() 功能不是最理想的。
sort.list(x, method=“radix”)，其中一些使用order的可能会快一些。
只是为了完整起见，因为关于按列号排序的说法并不多……可以肯定地说，这通常是不可取的（因为列的顺序可能会改变，从而为错误铺平道路)，但在某些特定情况下（例如，当您需要快速完成工作并且不存在列更改顺序的风险时），这可能是最明智的做法，尤其是在处理大量列时。
在这种情况下，do.call() 来救援：
ind <- do.call(what = "order", args = iris[,c(5,1,2,3)])
iris[ind, ]
## Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
## 14 4.3 3.0 1.1 0.1 setosa
## 9 4.4 2.9 1.4 0.2 setosa
## 39 4.4 3.0 1.3 0.2 setosa
## 43 4.4 3.2 1.3 0.2 setosa
## 42 4.5 2.3 1.3 0.3 setosa
## 4 4.6 3.1 1.5 0.2 setosa
## 48 4.6 3.2 1.4 0.2 setosa
## 7 4.6 3.4 1.4 0.3 setosa
## (...)
【讨论】：
当我想自动化我的 n 列的排序过程时，我一直在为上述解决方案苦苦挣扎，这些列的名称每次都可能不同。我从 psych 包中找到了一个非常有用的功能，可以直接完成此操作：
dfOrder(myDf, columnIndices)
其中columnIndices 是一列或多列的索引，按照您希望对它们进行排序的顺序。更多信息在这里：
【讨论】：
您可以直接使用order() 函数，而无需借助附加工具——请参阅这个更简单的答案，它使用了example(order) 代码顶部的技巧：
R> dd[with(dd, order(-z, b)), ]
b x y z
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2 年后编辑： 只是有人问如何按列索引来做到这一点。答案是简单地将所需的排序列传递给order() 函数：
R> dd[order(-dd[,4], dd[,1]), ]
b x y z
4 Low C 9 2
2 Med D 3 1
1 Hi A 8 1
3 Hi A 9 1
R>
而不是使用列的名称（和with() 以便更轻松/更直接地访问）。
【讨论】：
with。尝试M <- matrix(c(1,2,2,2,3,6,4,5), 4, 2, byrow=FALSE, dimnames=list(NULL, c("a","b"))) 创建矩阵M，然后使用M[order(M[,"a"],-M[,"b"]),] 在两列上排序。
dd[ order(-dd[,4], dd[,1]), ]，但不能将with 用于基于名称的子集。
dd[ order(-dd[,4],, ] 无效或 'dd[ order(-dd[,4], ]' 基本上为什么需要dd[,1]？如果您只想排序，-dd[,4] 还不够吗？ 1 列？
xtfrm 中来解决它，例如dd[ order(-xtfrm(dd[,4]), dd[,1]), ]。
另一种选择，使用rgr 包：
> library(rgr)
> gx.sort.df(dd, ~ -z+b)
b x y z
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【讨论】：
使用this (very helpful) function by Kevin Wright，发布在 R wiki 的提示部分，这很容易实现。
sort(dd,by = ~ -z + b)
# b x y z
# 4 Low C 9 2
# 2 Med D 3 1
# 1 Hi A 8 1
# 3 Hi A 9 1
【讨论】：
响应 OP 中添加的关于如何以编程方式排序的评论：
使用dplyr 和data.table
library(dplyr)
library(data.table)
只需使用arrange_，这是arrange 的标准评估版本。
df1 <- tbl_df(iris)
#using strings or formula
arrange_(df1, c('Petal.Length', 'Petal.Width'))
arrange_(df1, ~Petal.Length, ~Petal.Width)
Source: local data frame [150 x 5]
Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
(dbl) (dbl) (dbl) (dbl) (fctr)
1 4.6 3.6 1.0 0.2 setosa
2 4.3 3.0 1.1 0.1 setosa
3 5.8 4.0 1.2 0.2 setosa
4 5.0 3.2 1.2 0.2 setosa
5 4.7 3.2 1.3 0.2 setosa
6 5.4 3.9 1.3 0.4 setosa
7 5.5 3.5 1.3 0.2 setosa
8 4.4 3.0 1.3 0.2 setosa
9 5.0 3.5 1.3 0.3 setosa
10 4.5 2.3 1.3 0.3 setosa
.. ... ... ... ... ...
#Or using a variable
sortBy <- c('Petal.Length', 'Petal.Width')
arrange_(df1, .dots = sortBy)
Source: local data frame [150 x 5]
Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
(dbl) (dbl) (dbl) (dbl) (fctr)
1 4.6 3.6 1.0 0.2 setosa
2 4.3 3.0 1.1 0.1 setosa
3 5.8 4.0 1.2 0.2 setosa
4 5.0 3.2 1.2 0.2 setosa
5 4.7 3.2 1.3 0.2 setosa
6 5.5 3.5 1.3 0.2 setosa
7 4.4 3.0 1.3 0.2 setosa
8 4.4 3.2 1.3 0.2 setosa
9 5.0 3.5 1.3 0.3 setosa
10 4.5 2.3 1.3 0.3 setosa
.. ... ... ... ... ...
#Doing the same operation except sorting Petal.Length in descending order
sortByDesc <- c('desc(Petal.Length)', 'Petal.Width')
arrange_(df1, .dots = sortByDesc)
更多信息在这里：https://cran.r-project.org/web/packages/dplyr/vignettes/nse.html
最好使用公式，因为它还可以捕获环境来评估表达式
dt1 <- data.table(iris) #not really required, as you can work directly on your data.frame
sortBy <- c('Petal.Length', 'Petal.Width')
sortType <- c(-1, 1)
setorderv(dt1, sortBy, sortType)
dt1
Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
1: 7.7 2.6 6.9 2.3 virginica
2: 7.7 2.8 6.7 2.0 virginica
3: 7.7 3.8 6.7 2.2 virginica
4: 7.6 3.0 6.6 2.1 virginica
5: 7.9 3.8 6.4 2.0 virginica
---
146: 5.4 3.9 1.3 0.4 setosa
147: 5.8 4.0 1.2 0.2 setosa
148: 5.0 3.2 1.2 0.2 setosa
149: 4.3 3.0 1.1 0.1 setosa
150: 4.6 3.6 1.0 0.2 setosa
【讨论】：
为了完整起见：您还可以使用BBmisc 包中的sortByCol() 函数：
library(BBmisc)
sortByCol(dd, c("z", "b"), asc = c(FALSE, TRUE))
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性能对比：
library(microbenchmark)
microbenchmark(sortByCol(dd, c("z", "b"), asc = c(FALSE, TRUE)), times = 100000)
median 202.878
library(plyr)
microbenchmark(arrange(dd,desc(z),b),times=100000)
median 148.758
microbenchmark(dd[with(dd, order(-z, b)), ], times = 100000)
median 115.872
【讨论】：
data.frame987654325@ 上使用基准测试的价值值得怀疑
R 包data.table 提供快速 和内存高效 的data.tables 排序，语法简单（其中一部分马特很好地突出了in his answer）。从那时起，已经有了很多改进，还有一个新功能setorder()。从v1.9.5+，setorder() 也适用于data.frames。
首先，我们将创建一个足够大的数据集，并对其他答案中提到的不同方法进行基准测试，然后列出 data.table 的特征。
require(plyr)
require(doBy)
require(data.table)
require(dplyr)
require(taRifx)
set.seed(45L)
dat = data.frame(b = as.factor(sample(c("Hi", "Med", "Low"), 1e8, TRUE)),
x = sample(c("A", "D", "C"), 1e8, TRUE),
y = sample(100, 1e8, TRUE),
z = sample(5, 1e8, TRUE),
stringsAsFactors = FALSE)
报告的时间来自在下面显示的这些函数上运行 system.time(...)。时间如下表所示（按从慢到快的顺序）。
orderBy( ~ -z + b, data = dat) ## doBy
plyr::arrange(dat, desc(z), b) ## plyr
arrange(dat, desc(z), b) ## dplyr
sort(dat, f = ~ -z + b) ## taRifx
dat[with(dat, order(-z, b)), ] ## base R
# convert to data.table, by reference
setDT(dat)
dat[order(-z, b)] ## data.table, base R like syntax
setorder(dat, -z, b) ## data.table, using setorder()
## setorder() now also works with data.frames
# R-session memory usage (BEFORE) = ~2GB (size of 'dat')
# ------------------------------------------------------------
# Package function Time (s) Peak memory Memory used
# ------------------------------------------------------------
# doBy orderBy 409.7 6.7 GB 4.7 GB
# taRifx sort 400.8 6.7 GB 4.7 GB
# plyr arrange 318.8 5.6 GB 3.6 GB
# base R order 299.0 5.6 GB 3.6 GB
# dplyr arrange 62.7 4.2 GB 2.2 GB
# ------------------------------------------------------------
# data.table order 6.2 4.2 GB 2.2 GB
# data.table setorder 4.5 2.4 GB 0.4 GB
# ------------------------------------------------------------
data.table 的 DT[order(...)] 语法比其他最快的方法 (dplyr) 快 ~10 倍，同时消耗的内存量与 dplyr 相同。
data.table 的 setorder() 比其他最快的方法 (dplyr) 快 ~14 倍，同时占用 仅 0.4GB 额外内存。 dat 现在是我们需要的顺序（因为它是通过引用更新的）。
速度：
data.table 的排序非常快，因为它实现了radix ordering。
DT[order(...)] 语法在内部进行了优化，以使用 data.table 的快速排序。您可以继续使用熟悉的基本 R 语法，但会加快进程（并使用更少的内存）。
内存：
大多数时候，我们不需要重新排序后的原始 data.frame 或 data.table。也就是我们通常将结果赋值回同一个对象，例如：
DF <- DF[order(...)]
问题在于，这至少需要原始对象的两倍 (2x) 内存。为了内存效率，data.table因此也提供了一个函数setorder()。
setorder() 重新排序 data.tables by reference（就地），而无需制作任何额外的副本。它只使用等于一列大小的额外内存。
其他功能：
它支持integer、logical、numeric、character甚至bit64::integer64类型。
请注意，
factor、Date、POSIXct等类都是integer/numeric类型，带有附加属性，因此也受支持。
在基础 R 中，我们不能在字符向量上使用 - 来按该列按降序排序。相反，我们必须使用-xtfrm(.)。
但是，在 data.table 中，我们可以这样做，例如，dat[order(-x)] 或 setorder(dat, -x)。
【讨论】：
就像很久以前的机械卡片分类器一样，首先按最不重要的键排序，然后是下一个最重要的键，等等。不需要库，可以使用任意数量的键以及升序和降序键的任意组合。
dd <- dd[order(dd$b, decreasing = FALSE),]
现在我们已准备好执行最重要的密钥。排序是稳定的，并且最重要的键中的任何关系都已经解决了。
dd <- dd[order(dd$z, decreasing = TRUE),]
这可能不是最快的，但肯定简单可靠
【讨论】：
我通过以下示例了解了order，这让我困惑了很长时间：
set.seed(1234)
ID = 1:10
Age = round(rnorm(10, 50, 1))
diag = c("Depression", "Bipolar")
Diagnosis = sample(diag, 10, replace=TRUE)
data = data.frame(ID, Age, Diagnosis)
databyAge = data[order(Age),]
databyAge
此示例有效的唯一原因是因为order 是按vector Age 排序的，而不是按data frame data 中名为Age 的列。
要查看这一点，使用 read.table 创建一个相同的数据框，列名略有不同，并且不使用上述任何向量：
my.data <- read.table(text = '
id age diagnosis
1 49 Depression
2 50 Depression
3 51 Depression
4 48 Depression
5 50 Depression
6 51 Bipolar
7 49 Bipolar
8 49 Bipolar
9 49 Bipolar
10 49 Depression
', header = TRUE)
order 的上述行结构不再有效，因为没有名为 age 的向量：
databyage = my.data[order(age),]
以下行有效，因为order 对my.data 中的age 列进行排序。
databyage = my.data[order(my.data$age),]
鉴于我对这个例子很困惑这么久，我认为这是值得发布的。如果这篇文章被认为不适合该主题，我可以将其删除。
编辑：2014 年 5 月 13 日
以下是按每一列对数据框进行排序的通用方法，无需指定列名。下面的代码显示了如何从左到右或从右到左排序。如果每列都是数字，则此方法有效。我没有尝试添加字符列。
我在一两个月前在另一个网站上的一篇旧帖子中找到了do.call 代码，但只是在经过广泛而艰难的搜索之后。我不确定我现在是否可以重新定位该职位。当前线程是在R 中订购data.frame 的第一个热门话题。所以，我认为我的原始 do.call 代码的扩展版本可能有用。
set.seed(1234)
v1 <- c(0,0,0,0, 0,0,0,0, 1,1,1,1, 1,1,1,1)
v2 <- c(0,0,0,0, 1,1,1,1, 0,0,0,0, 1,1,1,1)
v3 <- c(0,0,1,1, 0,0,1,1, 0,0,1,1, 0,0,1,1)
v4 <- c(0,1,0,1, 0,1,0,1, 0,1,0,1, 0,1,0,1)
df.1 <- data.frame(v1, v2, v3, v4)
df.1
rdf.1 <- df.1[sample(nrow(df.1), nrow(df.1), replace = FALSE),]
rdf.1
order.rdf.1 <- rdf.1[do.call(order, as.list(rdf.1)),]
order.rdf.1
order.rdf.2 <- rdf.1[do.call(order, rev(as.list(rdf.1))),]
order.rdf.2
rdf.3 <- data.frame(rdf.1$v2, rdf.1$v4, rdf.1$v3, rdf.1$v1)
rdf.3
order.rdf.3 <- rdf.1[do.call(order, as.list(rdf.3)),]
order.rdf.3
【讨论】：
require(data.table); my.dt <- data.table(my.data); my.dt[order(age)] 这是有效的，因为列名在 [] 括号内可用。跨度>
data.frames 捕获了使用with 或$ 的要求。
do.call 投票，这使得排序多列数据框的工作变得很短。只需do.call(sort, mydf.obj) 就会有一个漂亮的级联排序。
这里有很多优秀的答案，但dplyr 给出了唯一一种我可以快速轻松记住的语法（因此现在经常使用）：
library(dplyr)
# sort mtcars by mpg, ascending... use desc(mpg) for descending
arrange(mtcars, mpg)
# sort mtcars first by mpg, then by cyl, then by wt)
arrange(mtcars , mpg, cyl, wt)
对于 OP 的问题：
arrange(dd, desc(z), b)
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【讨论】：
dd[order(-z, b)] 很容易使用和记住。
data.table 在许多其他方面也对R 做出了巨大贡献。我想对我来说，这可能是在这种情况下少了一组括号（或少了一种类型的括号）可以将认知负荷降低到几乎无法察觉的程度。
arrange() 是完全声明性的，dd[order(-z, b)] 不是。
德克的回答很棒。它还强调了用于索引data.frames 和data.tables 的语法的关键区别：
## The data.frame way
dd[with(dd, order(-z, b)), ]
## The data.table way: (7 fewer characters, but that's not the important bit)
dd[order(-z, b)]
这两个调用之间的差异很小，但它可能会产生重要的后果。特别是如果您编写生产代码和/或关注研究的正确性，最好避免不必要的变量名重复。 data.table
帮助您做到这一点。
以下是变量名称重复可能会给您带来麻烦的示例：
让我们从 Dirk 的回答中改变上下文，并说这是一个更大的项目的一部分，其中有很多对象名称，它们又长又有意义；而不是dd，它被称为quarterlyreport。它变成：
quarterlyreport[with(quarterlyreport,order(-z,b)),]
好的，好的。没有错。接下来，您的老板要求您在报告中包含上一季度的报告。你浏览你的代码，在不同的地方添加一个对象lastquarterlyreport，然后不知何故（到底是怎么回事？）你最终得到了这个：
quarterlyreport[with(lastquarterlyreport,order(-z,b)),]
这不是您的意思，但您没有发现它，因为您做得很快，并且它位于类似代码的页面上。代码不会失败（没有警告也没有错误），因为 R 认为这就是您的意思。你希望任何阅读你报告的人都能发现它，但也许他们没有。如果您经常使用编程语言，那么这种情况可能很熟悉。你会说这是一个“错字”。我会改正你要对老板说的“错字”。
在data.table 中，我们担心这样的微小细节。所以我们做了一些简单的事情来避免两次输入变量名。很简单的事情。 i 已经在 dd 的框架内自动评估。你根本不需要with()。
而不是
dd[with(dd, order(-z, b)), ]
只是
dd[order(-z, b)]
而不是
quarterlyreport[with(lastquarterlyreport,order(-z,b)),]
只是
quarterlyreport[order(-z,b)]
这是一个非常小的差异，但它可能有一天会挽救你的脖子。在权衡这个问题的不同答案时，考虑将变量名称的重复次数作为决定的标准之一。有些答案有很多重复，有些则没有。
【讨论】：
subset() 只是为了避免在一次调用中重复引用同一个对象。
setorder 函数，因为这个线程是我们发送所有order 类型欺骗的地方。
假设您有一个 data.frame A 并且您想使用名为 x 的列降序对其进行排序。调用排序后的data.framenewdata
newdata <- A[order(-A$x),]
如果您想要升序，则将"-" 替换为空。你可以有类似的东西
newdata <- A[order(-A$x, A$y, -A$z),]
其中x 和z 是data.frame A 中的一些列。这意味着按x 降序、y 升序和z 降序对data.frame A 进行排序。
【讨论】：
Dirk 的回答很好，但如果您需要排序持久化，您需要将排序应用回该数据框的名称。使用示例代码：
dd <- dd[with(dd, order(-z, b)), ]
【讨论】：
或者你可以使用包doBy
library(doBy)
dd <- orderBy(~-z+b, data=dd)
【讨论】：
或者，使用包 Deducer
library(Deducer)
dd<- sortData(dd,c("z","b"),increasing= c(FALSE,TRUE))
【讨论】：