【发布时间】:2014-10-16 16:51:54
【问题描述】:
我的目标是将 R 中的数据表中的列转换为矩阵,以便我可以将其合并到以后在我的项目中使用。 从数据集中,我将“AGE”列中的所有值保存到一个变量中:
AGE.data <- sample_data(phy.norm.new)[,'AGE']
这样做产生了:
样本数据:[240 个样本,1 个样本变量]:
年龄
AGE.109 56
AGE.236 50
AGE.201 34
AGE.96 64
AGE.21 66
年龄.56 54
年龄.64 65
年龄.225 76
AGE.24 70
年龄.57 84
AGE.117 50
年龄.177 65
...
(并非所有行都已在此块引用中输入,仅几行是为了说明它在控制台中的样子)。
为了将此列中的值转换为矩阵,我使用了:
mat.AGE.data <- matrix(AGE.data)
但是,我没有得到显示所有年龄值的 240 行 x 1 列矩阵。相反,它会显示在控制台中。
mat.AGE.data
[,1]
[1,] Integer,240
我已阅读全面的 R 教程,但我仍然不确定如何解决此问题。提前致谢。
编辑: 使用 str(AGE.data) 我得到了这个输出:
'data.frame':240 obs。 1 个变量:
具有 4 个插槽的正式类 'sample_data' [package "phyloseq"]
..@ .Data :1 的列表
.. ..$ : int 56 50 34 64 66 54 65 76 70 84 ...
..@ 名称:chr "AGE"
..@ row.names: 字符 "CRC.109" "CRC.236" "CRC.201" "CRC.96" ...
..@ .S3Class : chr "data.frame"
dput(head(AGE.data, 10))
new("sample_data"
, .Data = list(c(56L, 50L, 34L, 64L, 66L, 54L, 65L, 76L, 70L, 84L))
, 姓名 = "年龄"
, row.names = c("AGE.109", "AGE.236", "AGE.201", "AGE.96", "AGE.21", "AGE.56",
"AGE.64", "AGE.225", "AGE.24", "AGE.57"), .S3Class = "data.frame"
)
【问题讨论】:
-
请查看
str(AGE.data)。此外,尚不清楚这是data.table,还是table,还是data.frame -
@akrun 我编辑了我的帖子以包含 str(AGE.data) 的输出。
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你能不能
dput输出,即dput(head(AGE.data, 10))。好像是一个列表输出。 -
@akrun 我已经编辑了我的帖子以包含它
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它给了我错误。我没有安装包
phyloseq。希望有人会回应。