将重复的行转置到 R 中的列答案

【问题标题】：Transpose duplicated rows to column in R将重复的行转置到 R 中的列
【发布时间】：2013-07-27 11:36:11
【问题描述】：

我有一个大的 data.frame（20000 多个条目），格式如下：

id  D1      D2
1   0.40    0.21
1   0.00    0.00
1   0.53    0.20
2   0.17    0.17
2   0.25    0.25
2   0.55    0.43

每个 id 可以重复 3-20 次。我想将重复的行合并到新列中，所以我的新 data.frame 看起来像：

id  D1      D2      D3      D4      D5      D6
1   0.40    0.21    0.00    0.00    0.53    0.20
2   0.17    0.17    0.25    0.25    0.55    0.43

我之前使用 plyr 操作过 data.frames，但我不确定如何解决这个问题。任何帮助将不胜感激。谢谢。

【问题讨论】：

标签： r duplicates plyr reshape

【解决方案1】：

最好的选择是只使用“reshape2”中的melt 和dcast。但在我们跳到那个选项之前，让我们看看我们还有什么可用的：

您提到每个“id”的行数是不平衡的。这会使放入一个整洁的矩形data.frame 有点困难。

这里有几个例子。

平衡数据：每个“id”三行

mydf <- structure(list(id = c(1, 1, 1, 2, 2, 2), 
                       D1 = c(0.4, 0, 0.53, 0.17, 0.25, 0.55), 
                       D2 = c(0.21, 0, 0.2, 0.17, 0.25, 0.43)), 
                  .Names = c("id", "D1", "D2"), row.names = c(NA, 6L), 
                  class = "data.frame")
mydf
#   id   D1   D2
# 1  1 0.40 0.21
# 2  1 0.00 0.00
# 3  1 0.53 0.20
# 4  2 0.17 0.17
# 5  2 0.25 0.25
# 6  2 0.55 0.43

有了这些数据，你可以直接使用aggregate：

do.call(data.frame, aggregate(. ~ id, mydf, as.vector))
#   id D1.1 D1.2 D1.3 D2.1 D2.2 D2.3
# 1  1 0.40 0.00 0.53 0.21 0.00 0.20
# 2  2 0.17 0.25 0.55 0.17 0.25 0.43

不平衡数据：一些解决方法

如果您为“id = 2”添加了第四个值，aggregate 在此处将不起作用：

mydf[7, ] <- c(2, .44, .33)
do.call(data.frame, aggregate(. ~ id, mydf, as.vector))
# Error in data.frame(`0` = c(0.4, 0, 0.53), `1` = c(0.17, 0.25, 0.55, 0.44 : 
#   arguments imply differing number of rows: 3, 4

最好只使用生成的vectors 中的list：

lapply(split(mydf[-1], mydf[[1]]), function(x) unlist(x, use.names=FALSE))
# $`1`
# [1] 0.40 0.00 0.53 0.21 0.00 0.20
# 
# $`2`
# [1] 0.17 0.25 0.55 0.44 0.17 0.25 0.43 0.33
#

或者，如果您坚持使用矩形data.frame，请探索rbind 不平衡数据的几个工具之一，例如，来自“plyr”的rbind.fill：

library(plyr)
rbind.fill(lapply(split(mydf[-1], mydf[[1]]), 
                  function(x) data.frame(t(unlist(x, use.names=FALSE)))))
#     X1   X2   X3   X4   X5   X6   X7   X8
# 1 0.40 0.00 0.53 0.21 0.00 0.20   NA   NA
# 2 0.17 0.25 0.55 0.44 0.17 0.25 0.43 0.33

不平衡数据：更直接的方法

或者，您可以使用“reshape2”中的melt 和dcast，如下所示：

library(reshape2)
x <- melt(mydf, id.vars = "id")
## ^^ That's not enough information for `dcast`
##    We need a "time" variable too, so use `ave`
##      to create one according to the number of
##      values per ID.
x$time <- ave(x$id, x$id, FUN = seq_along)
## ^^ I would probably actually stop at this point.
##    Long data with proper ID and "time" values
##      tend to be easier to work with and many
##      other functions in R work more nicely with
##      this long data format.
dcast(x, id ~ time, value.var = "value")
#   id    1    2    3    4    5    6    7    8
# 1  1 0.40 0.00 0.53 0.21 0.00 0.20   NA   NA
# 2  2 0.17 0.25 0.55 0.44 0.17 0.25 0.43 0.33

【讨论】：