【问题标题】:Convert csv to parquet file using python使用python将csv转换为镶木地板文件
【发布时间】:2018-11-09 06:38:06
【问题描述】:

我正在尝试将 .csv 文件转换为 .parquet 文件。
csv 文件 (Temp.csv) 具有以下格式

1,Jon,Doe,Denver

我正在使用以下python代码将其转换为镶木地板

from pyspark import SparkContext
from pyspark.sql import SQLContext
from pyspark.sql.types import *
import os

if __name__ == "__main__":
    sc = SparkContext(appName="CSV2Parquet")
    sqlContext = SQLContext(sc)

    schema = StructType([
            StructField("col1", IntegerType(), True),
            StructField("col2", StringType(), True),
            StructField("col3", StringType(), True),
            StructField("col4", StringType(), True)])
    dirname = os.path.dirname(os.path.abspath(__file__))
    csvfilename = os.path.join(dirname,'Temp.csv')    
    rdd = sc.textFile(csvfilename).map(lambda line: line.split(","))
    df = sqlContext.createDataFrame(rdd, schema)
    parquetfilename = os.path.join(dirname,'output.parquet')    
    df.write.mode('overwrite').parquet(parquetfilename)

结果只是一个名为 output.parquet 的文件夹,而不是我正在寻找的 parquet 文件,随后控制台上出现以下错误。

我也尝试运行以下代码来面对类似的问题。

from pyspark.sql import SparkSession
import os

spark = SparkSession \
    .builder \
    .appName("Protob Conversion to Parquet") \
    .config("spark.some.config.option", "some-value") \
    .getOrCreate()

# read csv
dirname = os.path.dirname(os.path.abspath(__file__))
csvfilename = os.path.join(dirname,'Temp.csv')    
df = spark.read.csv(csvfilename)

# Displays the content of the DataFrame to stdout
df.show()
parquetfilename = os.path.join(dirname,'output.parquet')    
df.write.mode('overwrite').parquet(parquetfilename)

如何做到最好?使用windows,python 2.7。

【问题讨论】:

  • @lwileczek 这是一个不同的问题,因为链接的问题明确要求 Spark,这只是一般使用 Python。

标签: python csv parquet


【解决方案1】:

使用包 pyarrowpandas,您可以将 CSV 转换为 Parquet,而无需在后台使用 JVM:

import pandas as pd
df = pd.read_csv('example.csv')
df.to_parquet('output.parquet')

您将运行的一个限制是pyarrow 仅适用于 Windows 上的 Python 3.5+。使用 Linux/OSX 将代码作为 Python 2 运行,或者将您的 Windows 设置升级到 Python 3.6。

【讨论】:

  • 感谢您的回答。没有办法在 Windows 上使用 Python 2.7 吗?
  • 这是一种将单个文件转换为 parquet 文件的非常简单的方法,但是如果我们有多个 csv 文件,并且想将其 parquet 为单个 parquet 文件怎么办?
  • @Zombraz 您可以遍历文件并将每个文件转换为镶木地板,如果您正在寻找 python 之外的任何东西,AWS EMR 上的 hive 非常适合将 csv 转换为镶木地板
  • @Zombraz - 您可以使用 Dask 或 PySpark 将多个 CSV 文件转换为单个 Parquet 文件(或多个 Parquet 文件)。有关详细信息,请参阅我的答案。
【解决方案2】:

您可以仅使用 pyarrow 将 csv 转换为镶木地板 - 无需 pandas。 当您需要最小化代码依赖关系(例如使用 AWS Lambda)时,它可能会很有用。

import pyarrow.csv as pv
import pyarrow.parquet as pq

table = pv.read_csv(filename)
pq.write_table(table, filename.replace('csv', 'parquet'))

请参阅 pyarrow 文档以微调 read_csvwrite_table 函数。

【讨论】:

    【解决方案3】:
    import boto3
    import pandas as pd
    import pyarrow as pa
    from s3fs import S3FileSystem
    import pyarrow.parquet as pq
    
    s3 = boto3.client('s3',region_name='us-east-2')
    obj = s3.get_object(Bucket='ssiworkoutput', Key='file_Folder/File_Name.csv')
    df = pd.read_csv(obj['Body'])
    
    table = pa.Table.from_pandas(df)
    
    output_file = "s3://ssiworkoutput/file/output.parquet"  # S3 Path need to mention
    s3 = S3FileSystem()
    
    pq.write_to_dataset(table=table,
                        root_path=output_file,partition_cols=['Year','Month'],
                        filesystem=s3)
    
    print("File converted from CSV to parquet completed")
    

    【讨论】:

    • 这是从 AWS S3 路径读取 CSV 文件的代码,以 Parquet 格式存储它,并在 AWS S3 路径中分区。
    • 确保运行以下命令,pip3 install boto3 pip3 install pandas pip3 install pyarrow pip3 install fs-s3fs pip3 install s3fs
    • 你是如何在 aws 上安装 pyarrow 而没有包大小问题的?
    • @Haha 最简单的方法是使用已经包含 pyarrow 的awswrangler
    【解决方案4】:

    有几种不同的方法可以使用 Python 将 CSV 文件转换为 Parquet。

    Uwe L. Korn 的 Pandas 方法效果很好。

    如果您想将多个 CSV 文件转换为多个 Parquet / 单个 Parquet 文件,请使用 Dask。这会将多个 CSV 文件转换为两个 Parquet 文件:

    import dask.dataframe as dd
    
    df = dd.read_csv('./data/people/*.csv')
    df = df.repartition(npartitions=4)
    df.to_parquet('./tmp/people_parquet4')
    

    如果您只想输出一个 Parquet 文件,也可以使用 df.repartition(npartitions=1)。有关使用 Dask [此处][1] 将 CSV 转换为 Parquet 的更多信息。

    这是一个在 Spark 环境中工作的 PySpark sn-p:

    from pyspark.sql import SparkSession
    
    spark = SparkSession.builder \
      .master("local") \
      .appName("parquet_example") \
      .getOrCreate()
    
    df = spark.read.csv('data/us_presidents.csv', header = True)
    df.repartition(1).write.mode('overwrite').parquet('tmp/pyspark_us_presidents')
    

    您也可以在 Spark 环境中使用Koalas

    import databricks.koalas as ks
    
    df = ks.read_csv('data/us_presidents.csv')
    df.to_parquet('tmp/koala_us_presidents')
    

    【讨论】:

      【解决方案5】:

      您可以使用 spark 编写为 PARQUET FILE:

      spark = SparkSession.builder.appName("Test_Parquet").master("local[*]").getOrCreate()
      
      parquetDF = spark.read.csv("data.csv")
      
      parquetDF.coalesce(1).write.mode("overwrite").parquet("Parquet")
      

      希望对你有帮助

      【讨论】:

        【解决方案6】:
        from pyspark import SparkContext
        from pyspark.sql import SQLContext
        from pyspark.sql.types import *
        import sys
        
        sc = SparkContext(appName="CSV2Parquet")
        sqlContext = SQLContext(sc)
        
        schema = StructType([
            StructField("col1", StringType(), True),
            StructField("col2", StringType(), True),
            StructField("col3", StringType(), True),
            StructField("col4", StringType(), True),
            StructField("col5", StringType(), True)])
        rdd = sc.textFile('/input.csv').map(lambda line: line.split(","))
        df = sqlContext.createDataFrame(rdd, schema)
        df.write.parquet('/output.parquet')
        

        【讨论】:

        • 请添加一些解释为什么这回答了这个问题。
        • 使用 pyspark 将 csv 转换为镶木地板,这对我有用,希望对您有所帮助
        • 这种方法有效,但比使用 spark csv reader 慢几倍
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