如何将 conda 包导入谷歌 colab？答案

【问题标题】：how to import conda packages into google colab?如何将 conda 包导入谷歌 colab？
【发布时间】：2019-03-30 17:43:45
【问题描述】：

我能够使用 pip 在 google colab 中安装软件包，使用：

!pip install....

但我无法从 conda-forge 安装任何软件包。我试过了：

!conda install -c conda-forge cartopy

【问题讨论】：

如果你只想安装cartopy，使用!apt-get -qq install python-cartopy python3-cartopy。

标签： python conda google-colaboratory cartopy

【解决方案1】：

一般来说，这是从 Colab 在 conda 中安装包的一种方式：

!wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-4.5.4-Linux-x86_64.sh
!bash Miniconda3-4.5.4-Linux-x86_64.sh -bfp /usr/local
# Append path to be able to run packages installed with conda
import sys
sys.path.append('/usr/local/lib/python3.6/site-packages')
# Install packages from Anaconda
!conda install -y [package]

这适用于像 -c pslmodels taxcalc (notebook) 这样的包。

但是，cartopy 是一个复杂的包，在这里会产生问题，我认为因为上面需要旧版本的conda*，它不再与cartopy 兼容。这是一个使用此版本的Colab notebook，但由于cartopy 需要shapefile 包而失败，而this is one 使用最新版本的conda，在import 上无法识别。

* 例如，这里是install the latest installer 和run conda update conda 在安装taxcalc 之前的taxcalc 笔记本版本；在这两种情况下都无法识别import taxcalc。见this GitHub issue。

【讨论】：

【解决方案2】：

获取它的一种方法是直接将conda 包解压缩到一个目录。

从anaconda.org获取所需的conda包，下载。
解压后复制到库路径中

这是一个使用这种方式从 anaconda 安装 faiss 的示例。 https://gist.github.com/korakot/d0a49d7280bd3fb856ae6517bfe8da7a

【讨论】：

【解决方案3】：

另一个选项（我没有尝试过）是连接到自定义运行时（Jupyter 用语中的内核）。 https://research.google.com/colaboratory/local-runtimes.html

工作流程是：

用你想要的东西创建一个 conda 环境 + jupyter_http_over_ws
在您的机器上启动一个笔记本并connect colab as described

这可能不是您想要的，因为它确实需要本地安装（因此不再是零安装）。

【讨论】：

【解决方案4】：

我使用cartopy的解压方式。结果如下。

# get package then extract
!wget https://anaconda.org/conda-forge/cartopy/0.16.0/download/linux-64/cartopy-0.16.0-py36h81b52dc_2.tar.bz2
!tar xvjf cartopy-0.16.0-py36h81b52dc_2.tar.bz2
!cp -r lib/python3.6/site-packages/* /usr/local/lib/python3.6/dist-packages/
# install dependencies
!pip install shapely pyshp
!apt install libproj-dev libgeos-dev
# finally
import cartopy

【讨论】：