R gtsummary 包：如何在汇总表中操作/隐藏行

Question

我正在使用 gtsummary 开展一个项目。对于其中一个表，我必须在 matchit 过程之前和之后构建一个列出协变量的长表。

我的问题是，对于所有协变量（例如，肥胖），它读取一行，肥胖，然后是下一行，肥胖 em>，然后是下一个，Not Obese。这是三个表，我只想显示一个：糖尿病 N (%)。

我曾尝试编辑二分变量，引入Null，试图找到row_hide函数，但无济于事。

这是我的代码：

创建试验

trialCAS1 <- index_CAS %>%
select(TopDecile, Gender, Obesity, Diabetes, Diabetes_Complex, etc)

表摘要

CAStable1 <- tbl_summary(trialCAS1, 
by = TopDecile,
missing = "no") %>%
add_n() %>%
modify_header(label = "**Variable**") %>%
bold_labels()

我包含了我得到的第一张桌子。

Answer 1

tbl_summary() 函数会尽力猜测传递的数据类型（分类、二分类和连续）。它并不总是能猜出我们希望看到的内容，但始终可以使用 tbl_summary() 中的参数更改默认值！我将使用 {gtsummary} 包中的trial 数据集作为示例。

这是默认输出：

library(gtsummary)
trial %>%
  select(trt, grade, stage) %>%
  tbl_summary(by = trt)

默认情况下，成绩和阶段的汇总统计信息显示在多行上。然而，想象一下，我们只对 I 级疾病的发病率和 T1 期癌症的发病率感兴趣。我们可以使用tbl_summary(value=) 参数来指定这些是我们想要显示的唯一值（然后默认将这些值打印为二分变量）。在下面的示例中，我还更新了显示的标签，以表明这些只是 I 级和 T1 阶段的费率。

trial %>%
  select(trt, grade, stage) %>% 
  tbl_summary(
    by = trt,
    value = list(grade ~ "I",
                 stage ~ "T1"),
    label = list(grade ~ "Grade I",
                 stage ~ "Stage T1")
  ) 

根据我从您的代码和输出中看到的情况，我认为此代码适用于您的数据集：

tbl_summary(
  trialCAS1, 
  by = TopDecile,
  missing = "no".
  value = Obesity ~ "Obese",
  label = Obesity ~ "Obese"
)