【发布时间】:2025-12-04 12:30:01
【问题描述】:
在放弃其他方法来正确记录我的R 分析环境以实现分析重现性之后,我开始着手将每个单独的分析包装到docker 容器中。
这是我的工作:
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从
rockerproject拉取最新的rstudio容器:docker pull rocker/rstudio -
创建特定于项目的副本
docker run -d -p 8787:8787 rocker/rstudio # Produces baseID docker commit --message="Snapshot of current rocker/rstudio container" <baseID> rstudio_project.2018 docker stop <baseID> -
启动容器:
docker run -d -p 8787:8787 -e ROOT=TRUE rstudio_project.2018 # produces ID 基于
R(Studio)的项目分析...以sudo apt-get clean和sudo rm -rf /tmp/*结束-
导出 docker 镜像:
docker export -o docker_rstudio_project.2018.tar <ID> xz docker_rstudio_project.2018.tar
从我的本地注册表中删除所有相关的容器/图像后,我尝试模拟对打包项目的重新访问,如下所示:
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导入容器:
docker import docker_rstudio_project.2018.tar.xz rstudio_project.2018.2 -
(尝试)像原来一样启动容器:
docker run -d -p 8787:8787 -e ROOT=TRUE rstudio_project.2018.2
然后我面临以下错误:
docker: Error response from daemon: No command specified.
我做错了什么?容器在哪里丢失(什么)关于默认启动什么的信息?
【问题讨论】:
标签: r docker rstudio rstudio-server reproducible-research